生物化學 2008


上課簡訊
09/01/27
	本課程 97-2 下學期進度表已經排定。
08/12/28
	第二次考試成績公佈 (連結)。若覺得成績有問題，請一定要連絡 TA 複查成績。本次考試的平均分數較低 (比第一次低 6 分)，不過請勿擔心，因為不管三次考試的成績數字如何，最後的總成績都要做調整。因此，比較關鍵的是每個人之間的相對分數。
08/11/30
	第一次考試成績公佈 (連結)。若覺得成績有問題，請一定要連絡 TA 複查成績。
08/11/26
	莊榮輝上課部份已經全部完成，多謝大家努力上課考試，預祝期中、期末考順利。生物技術修改之檔案已經上網，請前往下載。第一次考試成績近日公佈。
08/11/25
	酵素部份考前解題班：連續兩週之週三、週五晚上 18:00 在 106 教室。 (時間地點) 將依照預定進度，在 12/10 (週三) 進行第二次考試，主要範圍：酵素。
08/11/13
	酵素機制之補充投影片，因為要強調動畫順序，特以 ppt 檔案供下載： [Enz(5A) 2008.PPT] 5 Mb (另有 pdf 檔案格式) 另有一篇相關 review 論文：TiBS (2005) 30:622-629 可下載深入了解活性區作用機制。
08/11/07
	第一次考題已經公佈 (連結)，請更進一步研究問題內容與答案。下週上課時將安排助教解題班，討論考試題目之內容 (大概還是週三、週五晚上)。
08/11/04
	第一次考試將如期舉行，請努力準備，考題題型與以前差不多，題目不盡相同。應考請攜帶學生證，請不要用鉛筆寫考卷，務必遵守考試規則。
08/10/24
班次	10/28 週二晚上 18:00 解題班還是在農化二館 106 教室 (女五宿舍附近)，由郭朝楨帶領。次日 10/29 週三解題班取消，10/24 及 10/31 週五照常舉行 (謝陸盛)。
08/10/22
	(1) 今天上課中討論問題： (a) 下段 peptide 有何性質？ -ELAIRLNKILFKLWEALDT- (投影片) (b) 有關蛋白質的 domain 或者 subunit 構造，何者為真？ (投影片) (2) 每週三、週五晚上 18:00 解題班繼續進行，可以全部參加。
08/10/17
	(1) 今天上課的討論問題：以下那一個事件是導致發現 double helix 最重要因素？ (投影片) (A) Rosaline Franklin's x-ray film (B) Purines and pyrimidines are nonpolar (C) Hydrogen bonds between base pairs (D) Chargaff's Rule (2) 請記得上網多看一些資料與影片：核酸。 (3) 今天晚上 18:00 第一次 TA 解題班，請多利用。生技系館在椰林大道物理館後面再後面棟，請由女五宿舍那個大門進入。
08/10/16
	(1) 很不巧，本班最後總人數 239 名，差 1 名即可增加一位助教 (80 x 3)。殘念！ (2) 提醒各位及早準備第一次考試，TA 將要開始帶領解題班。 (時間地點) (3) 上課提到的蛋白質與酵素技術方面的網站：酵素純化與分析、酵素化學實驗。
08/09/17
	(1) 第一天上課，加簽同學若覺得可以負擔本課程 (注意事項)，請在第三週加簽。 (2) 新的 Lehninger 課本之主要架構不變，但是細節有相當多更改 (超過 500 處)。 (3) 請趕快下載投影片，準備週五上課，並且開始籌組『讀書小組』。
08/09/16
	這張圖在檔案下載中新增：[0 Start 2007A.pdf] 或 [0 Start 2007B.pdf]
08/09/15
	(1) 請修習本課程者，第一週一定要準時上課，否則無法確定。 (2) 第一堂就會進入主題，請自行準備好講義 (如下)，隨堂上課。 (3) 莊榮輝部份，上課時不用帶 Lehninger 課本，最好有講義。
08/07/24
	(1) 年度 97-1 準備開課，講義改版完成，請自行從網頁下載。 (2) 今年仍然接受外系選修，但還是有一些限制與注意事項。 (3) Lehninger 課本第五版請自行向歐亞書局 8912-1188 訂購 (新生南路 88 號二樓之一)。 (4) 今年也有 C 類 TA 協助上課、改卷、問答、帶領讀書小組。

Teachers
Teachers	上學期：莊榮輝 juang@ntu.edu.tw + 李平篤 pingdu@ntu.edu.tw 下學期：楊健志 ccyang@ntu.edu.tw + 張世宗 shihchung@ntu.edu.tw
組別	TA	E-mail	Office-hour (解題班)
單號	郭朝楨	imbkuo@yahoo.com.tw	電話：3366-4521 時間：酵素解題班時間：12/03 週三 (18:00) 時間：12/08 週一 (18:00) 地點：生技系農化二館 106
雙號	謝陸盛	d92b47205@ntu.edu.tw	電話：3366-4442 時間：酵素解題班時間：12/05 週五 (18:00) 地點：生技系農化二館 106
TA	(1) 本年度也有兩位 C 類 TA 協助課程進行。 (2) TA 協助一般上課任務、改卷、答問、協助『讀書小組』進行不定期討論。 (3) TA 設有固定時間 (Office-hour)，定時定點解題或討論 (解題班)。

生物化學上課講義 2008

講義已經改版，請自行連結下載。

莊榮輝上課講義範圍，包含整個生物化學課程的前面三分之一，將在十一月底上完；其內容從概論的細胞與分子開始，經胺基酸與蛋白質，到最後的酵素；另外加上基礎核酸的部分，並增列生物技術簡介。上課將依本講義順序進行，所使用的投影片也整理上網，請自行下載。本講義的編排與課本不完全一致，下表列出其相關章節，作為對照。

講義內容		Nelson & Cox (2008) *Principles of Biochemistry* (5th ed.)
章	節	章	說明
細胞與分子	1) 生命源起	1 The foundation of biochemistry
	2) 細胞的生物化學	1 Cell
	3) 細胞分子	2 Water
胺基酸	1) ~ 4)	3 Amino acids, peptides, proteins	不含生化實驗技術
蛋白質	1) 蛋白質構造	4 The 3-D structure of proteins
蛋白質	2) 蛋白質性質	5 Protein function	不含免疫學部份
核酸	1) 分子構造	8 Nucleotides & nucleic acids	核酸構造
	2) 功能性質	8 Nucleotides & nucleic acids	核酸化學
	3) 研究技術	9 DNA-based information technologies	散佈在各小節
酵素	1) 酵素的命名	6 Enzymes (含部份 12 Biosignaling)	Introduction
	2) 酵素的構成		Introduction
	3) 酵素動力學		Kinetics
	4) 酵素的抑制		Inhibition
	5) 酵素的催化機制		Mechanism
	6) 酵素活性的調節		Regulatory Enzymes
	7) 細胞代謝與酵素調控		代謝課程的預備
	8) 酵素在生物技術應用	9 DNA-based information technologies
請詳細閱讀課本，多上其官方網站遛覽，並且做好每章的練習題。

選課前請注意︰

本生物化學課程內容『不包含 分子生物學』部份，選課前請特別注意。

全部在普通教室 103 上課。每週週三及週五兩天，每天上午 8:10 準時上課，請勿遲到。

期中考及期末考請依照本表之安排進行，因正當事故未能應考者，要事先請假。

考試時請攜帶學生證，並在指定座位應考；若有違規事件，完全依校規處理。

除了規定的考試外，各教師可能會有小考，以便查核學生學習成果。

未修過有機化學者，不適合修習本課程；本課程份量較重，而且要求嚴格，不是以生物化學為主修的同學，請選修生化乙或者其他生物化學基礎課程。

由於排課關係，原則上本班專供生化科技學系同學選修，生命科學系同學，請選修生化科學所開授之生化甲或生化乙。

理學院、生農學院各系，若經貴系同意，可選修本課程 (本課程不含分子生物學)；請注意，非生化科技系同學若選修本班，貴系可能不計入必修或必選學分。

以下課程表所列的進度僅供參考，實際進度視教師上課情形而定。

●

特別宣告

本課程已申請教務處『C 類教學助理 TA』之補助

(1) C 類教學助理 TA 將由修過本課程之研究生擔任，沒有分組討論。

(2) 強烈建議同學們自行組成『讀書小組』自動聚會討論課程內容。

(3) 讀書小組可以邀請 TA 出席指導討論或解題 (但無法每週、每組都參加)。

(4) 平常上課時 TA 也會出席，可利用上下課時間問答。

(5) 兩位 TA 將開設『解題班』幫忙同學解答生化題目，時間地點另定。

(6) 可用 e-mail 與 TA 討論，但依照學號分成單號、雙號兩組 (TA 成員)。

97-1 生物化學 (左、中欄) 及生化實驗 (右欄) 上課進度表 2008 修訂版
週	週三		週五		週	生化實驗 BCX
1	09/17	Introduction	09/19	Life	1	X	分組與基本操作	張
2	09/24	Water	09/26	Amino acid	2	P1	蛋白質分離	張
3	10/01	Protein 1	10/03	Protein 2	3	P1	蛋白質定量	張
4	10/08	Protein 3	10/10	放假	4	P2	親和層析法	張
5	10/15	Protein 4	10/17	Nucleic acid 1	5	P3/S2a	膠體電泳轉印	張
6	10/22	Nucleic acid 2	10/24	Nucleic acid 3	6	S2b	免疫染色	張
7	10/29	Nucleic acid 3	10/31	Enzyme 1, 2	7	P4	膠體過濾	張
8	11/05	Enzyme 3	11/07	Exam 1	8	S3	酵素動力學	張
9	11/12	Enzyme 4	11/14	Enzyme 5	9		期中考停課
10	11/19	Enzyme 6	11/21	Enzyme 7	10	M	生物資訊學	楊
11	11/26	Biotechnology	11/28	Carbohydrates	11	M3	分子模型組裝	楊
12	12/03	Carbohydrates	12/05	Glycobiology	12	M4	分子模擬	楊
13	12/10	Exam 2	12/12	Glycobiology	13	M2	醣類薄層層析	楊
14	12/17	Bioenergetics	12/19	Bioenergetics	14	N1	DNA 純化	王
15	12/24	Glycolysis	12/26	Glycolysis	15	N2	基因增殖	王
16	12/31	Glycolysis	01/02	Metabolic regulation	16	N3	限制脢檢定	王
17	01/07	Metabolic regulation	01/09	Metabolic regulation	17
18	01/14	Exam 3			18
台灣大學年度行事曆

週	週三		週五
1	2/18	Ch 14 Glycolysis (cont.)	2/20	Ch 15 Metabolic Regulation
2	2/25	Ch 15 Metabolic Regulation	2/27	Ch 16 Citric Acid Cycle
3	3/04	Ch 16 Citric Acid Cycle	3/06	Ch 16 Citric Acid Cycle
4	3/11	Ch 19 Oxidative phosphorylation	3/13	Ch 19 Oxidative phosphorylation
5	3/18	Ch 19 Oxidative phosphorylation	3/20	Ch 20 Carbohydrate biosynthesis
6	3/25	Ch 20 Carbohydrate biosynthesis	3/27	Ch 20 Carbohydrate biosynthesis
7	4/01	Ch 20 Photosynthesis	4/03	放假
8	4/08	1st Exam (佔 125/300)	4/10	Ch 10 Lipids
9	4/15	Ch 10 Lipids	4/17	Ch 11 Membrane
10	4/22	Ch 11 Membrane	4/24	Ch 12 Biosignaling
11	4/29	Ch 12 Biosignaling	5/01	Ch 17 Fatty acid catabolism
12	5/06	Ch 17 Fatty acid catabolism	5/08	Ch 21 Lipid biosynthesis
13	5/13	Ch 21 Lipid biosynthesis	5/15	Ch 21 Lipid biosynthesis
14	5/20	Ch 18 Amino acid oxidation	5/22	2nd Exam (佔 107/300)
15	5/27	Ch 18 Amino acid oxidation	5/29	Ch 18 Urea cycle
16	6/03	Ch 22 N-metabolism	6/05	Ch 22 N-metabolism
17	6/10	Ch 22 N-metabolism	6/12	Ch 22 N-metabolism
18	6/17	3rd Exam (佔 68/300)		-

任課教師：李平篤 (3366-9682) ; 楊健志 (3366-4445); 張世宗 (3366-3740)

生物化學網頁 Biochemistry 2008 首頁

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	教師及助教 (莊榮輝 Office-Hour)

檔案下載	上課講義 (pdf 下載) 另外也有網頁版：生物化學基礎
	參考試題 (歷年考試題目) 同學 Q&A 問題集 (歡迎同學來 e-mail 提問)
	Archives: 2007, 2006, 2005, 2004, 2003, 2002, 2001, 2000 (歷年上課網頁檔案)

有問題請 e-mail 給莊榮輝