N10

EcoRI site (GAATTC) is cut by EcoRI to generate sticky ends

天字第一號的限制脢為 EcoRI，是從大腸桿菌分離出來的，把 GAATTC 序列不對稱地切開，切口會形成 黏端 sticky ends (cohesive ends)。 具有相同 sticky ends 的核酸片段，可以互相準確地黏在一起，在基因重組技術上有很大貢獻。

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N11

EcoRV site (GATATC) yields blunt ends

有些限制脢 (EcoRV) 是在 parlindrome 序列的中央對稱地切開，成為平口的 鈍端 (blunt ends)。 兩個鈍端間雖然也可以進行連結，但其效率差很多，在基因重組上也有其用途。下面的連結是 Lehninger 生化教科書上的動畫教學，對 EcoRV 有非常深入的說明，請連結深入探討 (但遛覽器限定 Netscape)。

◆ Lehninger 3D Tutorials 請點選 Restrction Endonucleases (針對 EcoRV 的構造，要 Chime)

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N28

Principle and mechanism of PCR (polymerase chain reaction)

PCR 包括幾個基本步驟，並循環此基本步驟，以達到複製某段特定序列之目的：

  (1) 加入目標序列 (0)，加熱變性，使兩股分開。

  (2) 加入兩種引子 (primer)，此二引子各自界定目標序列的兩端。

  (3) 加入聚合脢 (DNA polymerase)，由引子延伸合成另一股 DNA。

  (4) 完成一次複製循環，所有引子、酵素都可重複使用，目標序列分子數量倍增 (2ⁿ)。

由以上基本機制，可衍生出各種多樣的 PCR 複製方式，請自行深入琢磨。

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Central Dogma

DNA is transcribed to mRNA that is translated to protein

依照 DNA 上面的核苷酸序列，可翻譯成蛋白質的胺基酸序列，這是如何做到的？

  (1) DNA 的序列可以 A=U 及 C=G 的互補關係，轉成 messenger RNA。

  (2) mRNA 與核糖體結合，準備開始進行轉譯蛋白質。

  (3) mRNA 序列以三個為一組，稱為『遺傳密碼』，每組密碼可對應一種胺基酸。

  (4) 由 RNA 譯成胺基酸序列時，需要有『翻譯者』，此翻譯者即為 tRNA。

  (5) 每個 tRNA 可說是一種介面，一邊認得特定的 RNA 密碼，一邊攜帶對應胺基酸。

  (6) 當 tRNA 一邊認出其特定密碼，一邊可把所攜帶的胺基酸接上去，連成蛋白質。

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