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Biochemistry Basics |
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核 酸 |
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Slide List |
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本目錄列出所有上課用到的幻燈片，除了註明資料來源及出處，並加以簡短說明文字。有些自製的圖片 (標以 ■)，因為沒有版權的問題，可以公開在本網頁，請點選該幻燈片名稱描述即可連結；點選每列左端的章節號碼，可以回到原講義的相關段落。而 ● 代表自製的動畫。 |
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▲ 到 Enzyme Slide |
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章節 |
頁數 |
圖表 |
幻燈片描述 |
說 明 |
頁 |
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| □ |
PowerPoint |
■ |
N01 |
生命現象的核心 |
- | ||
| ● | 1 |
PowerPoint |
■ |
N02 |
分子生物學部分沒有包含在內 |
N1 | |
| a |
PowerPoint |
■ |
N03 |
核 (鹼基) - 苷 (五碳糖) - 酸 (磷酸) |
N2 | ||
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Basics |
□ |
F1 |
分辨 nucleoside 與 nucleotide |
請自行查出詳細分子構造 |
N3 | ||
|
Mathews |
88 |
F4.2 |
四種鹼基的構造 (可以配對) |
發現雙螺旋構造的關鍵 |
N4 | ||
|
G&G |
332 |
box |
Caffeine 阻止 adenosine 與受體結合 |
Adenosine 是 autocoid 自體激素 |
N5 | ||
| b |
PowerPoint |
■ |
N04 |
Nucleotide 3'-(OH) → 5'-(PO4) |
N6 | ||
|
PowerPoint |
■ |
N05 |
注意 5'→3' 方向與磷、醣、鹼位置 |
N7 | |||
|
PowerPoint |
■ |
N06 |
像馬路的雙線有一定遵循方向 |
N8 | |||
|
Voet |
727 |
F23-1 |
鹼基間如何配對 A＝T; C≡G |
Watson-Crick pairing; 注意氫鍵位置 |
N9 | ||
| c |
MBCell |
99 |
F3-10 |
鹼基對平整排列在兩股磷酸之間 |
像旋轉式的樓梯一般 |
N10 | |
|
MCB |
11 |
FI-12 |
Watson, Crick 及 DNA 雙螺旋模型 |
本世紀最重大發現之一 |
N11 | ||
|
Lehninger |
336 |
F12-18 |
雙螺旋有 A, B, Z 三種形式 |
B 式最為常見 |
N12 | ||
|
PowerPoint |
■ |
N07 |
有扭曲現象： grooves |
N13 | |||
| d |
Stryer |
980 |
F37-9 |
磷酸脊骨上帶有大量負電 |
胞核內以鹼性蛋白質 histone 中和 |
N14 | |
|
Lehninger |
810 |
F23-31 |
DNA 一級一級捲繞成染色體 |
因此細胞可以順利地分裂 |
N15 | ||
|
Voet |
731 |
F23-4 |
核酸的分子構成也有相當的限制 |
因此有二級或三級構造 |
N16 | ||
|
Lehninger |
800 |
F23-11 |
橡皮圈的例子 |
兩股橡皮圈捲繞太緊會再次捲繞 |
N17 | ||
|
PowerPoint |
■ |
N08 |
超捲繞可以解除核酸分子的緊張 |
N18 | |||
|
Voet |
733 |
F23-9 |
超捲繞的例子 9 = 10 - 1 (W = -1) |
是 negative supercoil 超捲繞一圈 |
N19 | ||
| e |
PowerPoint |
■ |
N09 |
專一性的核酸水解酵素 |
N20 | ||
| (3b) |
PowerPoint |
● |
N10 |
限制脢可切在特定的核酸序列 |
N21 | ||
|
PowerPoint |
|
N10 |
EcoRI cutting |
不對稱切開兩股 |
N21 | ||
|
PowerPoint |
|
N10 |
EcoRI sticky ends |
Sticky ends 可再度配對 |
N21 | ||
|
PowerPoint |
● |
N11 |
另一種限制脢 |
N21 | |||
|
PowerPoint |
|
N11 |
EcoRV cutting |
對稱地切開 |
N21 | ||
|
PowerPoint |
|
N11 |
Blunt ends |
產生平口端 |
N21 | ||
|
Stryer |
792 |
F31-10 |
實際的例子 EcoRV 分子與 DNA |
對稱的酵素切在對稱的序列上 |
N22 | ||
|
Lehninger |
337 |
F12-21 |
Palindrome 可摺疊成十字形 |
可作為核酸長鏈分子上的書簽 |
N23 | ||
|
MBCell |
294 |
F7-3 |
限制脢的應用例子 |
對同一條核酸可切出不同的片段 |
N24 | ||
|
MBCell |
294 |
F7-3 |
可大略拼出核酸的組成 |
Restriction map 可檢定核酸的異同 |
N24 | ||
|
Mathews |
948 |
F25B.1 |
相同 sticky ends 可以互接 + ligase |
基因重組的第一步 |
N25 | ||
| f |
CMB |
101 |
F3-43 |
質體 (穿透式電顯照片) |
基因重組的重要載體 vector |
N26 | |
|
PowerPoint |
■ |
N12 |
也帶有遺傳訊息 (如抗藥性) |
N27 | |||
|
PowerPoint |
■ |
N13 |
也可表現此外來基因 |
N28 | |||
| (3d) |
PowerPoint |
■ |
N14 |
可大量複製並純化出 DNA 分子 |
N29 | ||
|
PowerPoint |
■ |
N15 |
生物學最基本的運作原則 |
N30 | |||
|
PowerPoint |
■ |
N16 |
可體驗整個 Central Dogma 過程 |
N31 | |||
| g |
Starr |
216 |
F16.12 |
Central Dogma 的想像圖 |
生成 RNA 都是為了製造蛋白質 |
N32 | |
|
牛頓 25 |
76-77 |
|
DNA 複製的卡通圖 |
DNA → DNA (詳見分子生物學) |
N33 | ||
|
Starr |
225 |
F17.11 |
mRNA 可以獨立表現出蛋白質 |
Acetabularia 單細胞植物 |
N34 | ||
|
MBCell |
107 |
F3-18 |
tRNA 有獨特構形 |
有非 Watson-Crick 的鹼基配對 |
N35 | ||
|
Lehninger |
329 |
F12-8 |
RNA 很容易遭到水解 |
因為有 2'-OH 之故 (還有 RNase) |
N36 | ||
| h |
PowerPoint |
■ |
N17 |
DNA 之一股分子上有一面模板 |
N37 | ||
|
PowerPoint |
■ |
N18 |
轉錄出來的 RNA 與 template 互補 |
N38 | |||
|
PowerPoint |
■ |
N19 |
如何決定一段 DNA 是 template？ |
N39 | |||
|
Lehninger |
859 |
F25-2 |
不同基因在同一條 DNA 上可重疊 |
但各基因的 5'→3' 方向不會改變 |
N40 | ||
|
PowerPoint |
■ |
N20 |
會阻止 mRNA 的表現 |
N41 | |||
|
MBCell |
326 |
F7-43 |
反義 RNA 可從 nontemplate 得來 |
理論上可抑制某特定基因 |
N42 | ||
|
Lehninger |
858 |
F25-1 |
轉錄 RNA |
RNA 是依 DNA 序列全盤照錄 |
N43 | ||
| (2f) |
PowerPoint |
■ |
N21 |
真核細胞基因上的 DNA 並非連續 |
N44 | ||
|
Lehninger |
867 |
F25-11 |
Intron 的發現 (周芷) |
mRNA 與其 DNA 的雜合 → R loop |
N45 | ||
|
PowerPoint |
■ |
N22 |
用逆向轉錄脢把 mRNA 轉成 cDNA |
N46 | |||
| (3e) |
PowerPoint |
■ |
N23 |
各有用途及特點 |
N47 | ||
|
Mathews |
233 |
F7.20 |
Hemoglobin 基因有三段 exons |
可能由三段迷你基因所演化組合 |
N48 | ||
|
Stryer |
153 |
F7-14 |
Exon 2 表現蛋白質即有部分功能 |
胺基酸 32~139 片段為 mini mb |
N49 | ||
| ● | 2 |
PowerPoint |
■ |
N24 |
最重要的性質： 變形與復性 |
N50 | |
| a |
PowerPoint |
■ |
N25 |
(1) ATP (2) 輔脢 (3) 第二傳信者 |
N51 | ||
|
G&G |
756 |
F23.17 |
UDP-Glc 可以將葡萄糖合成肝糖 |
一種標記作用 |
N52 | ||
| c |
G&G |
373 |
F12.19 |
變性與復性 |
加熱可以打開核酸的兩股 |
N53 | |
|
Voet |
739 |
F23-17 |
每條 DNA 有固定的變性溫度 Tm |
DNA 變性可測 260 nm 吸光度升高 |
N54 | ||
| d |
G&G |
372 |
F12.17 |
C+G% 越高的核酸 Tm 越高 |
因為 G≡C 之間有三個氫鍵 |
N55 | |
|
G&G |
375 |
F12.21 |
C+G% 越高的核酸分子密度也高 |
因為兩股間纏繞較緊密 |
N56 | ||
|
G&G |
372 |
F12.18 |
Tm 與溶液中的 NaCl 濃度也有關 |
因為離子可以中和磷酸脊骨的電荷 |
N55 | ||
|
G&G |
374 |
F12.20 |
Cot 指示 DNA 的複雜程度 |
越複雜的 DNA 復性的時間越長 |
N57 | ||
| e |
PowerPoint |
■ |
N26 |
DNA/DNA, RNA/RNA, DNA/RNA |
N58 | ||
|
Basics |
□ |
F2 |
核酸探針的設計與合成 |
可以由胺基酸序列反推核酸序列 |
- | ||
| (3c) |
Basics |
□ |
F2 |
核酸探針雜合反應 |
可以挑出樣本中的目標基因 |
- | |
|
MBCell |
313 |
F7-26 |
Colony hybridization |
實際的應用例子 |
N59 | ||
|
MBCell |
302 |
F7-13 |
Southern blotting |
樣本 DNA 也可以先跑電泳分離之 |
N60 | ||
|
MBCell |
302 |
F7-13 |
轉印後以探針雜合目標色帶 |
最常用的 DNA 檢定方法 |
N60 | ||
| (3f) |
PowerPoint |
■ |
N27 |
可放大染色體中指定的一段基因 |
N61 | ||
|
PowerPoint |
■● |
N28 |
加熱分開 DNA 雙股 (動畫) |
(以下 PCR 的連續圖解沒有收錄) |
a | ||
|
PowerPoint |
■ |
N28 |
加入引子界定目標基因的兩端 |
也加入聚合脢 |
a | ||
|
PowerPoint |
■ |
N28 |
DNA 複製 |
↓ Taq polymerase |
a | ||
|
PowerPoint |
■ |
N28 |
加熱變性並接上引子 |
2 x 2 條 DNA |
a | ||
|
PowerPoint |
■ |
N28 |
第二次複製 |
↓ Taq polymerase |
a | ||
|
PowerPoint |
■ |
N28 |
加熱變性並接上引子 |
2 x 2 x 2 條 DNA |
b | ||
|
PowerPoint |
■ |
N28 |
第三次複製 |
↓ Taq polymerase |
b | ||
|
PowerPoint |
■ |
N28 |
加熱變性並接上引子 |
2 x 2 x 2 x 2 條 DNA |
b | ||
|
PowerPoint |
■ |
N28 |
應用很廣；發明者已獲諾貝爾獎 |
b | |||
| (3g) |
Basics |
□ |
F3 |
核酸定序原理 |
不同長度的核酸泳動率不同 |
- | |
|
Basics |
□ |
F3 |
核酸定序的兩個方法 |
Maxam & Gilbert (化學法); Sanger (生合成法) |
- | ||
|
PowerPoint |
■ |
N29 |
雙去氧核苷酸 ddNTP |
作為 DNA 生合成反應的中止劑 |
N62 | ||
| ● | 3 |
PowerPoint |
■ |
N30 |
已分散在上面各節說明 |
N63 | |
| a |
Pharmacia |
無 |
|
以乙醇沉澱法純化核酸 |
純化核酸的方法都差不多 (為何？) |
- | |
| h |
PowerPoint |
■ |
N31 |
可改變蛋白質上指定的胺基酸 |
N64 | ||
| i |
MBCell |
303 |
F7-14 |
RFLP (限制脢片段的多樣性) |
檢定群族中的個體遺傳差異 |
N65 | |
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建立日期：2001/1/21 更新日期：2003/10/27 © 版權所有