2-DE Protocol

 　
　 　 　
　
　 　 　 2011 年 　
　 　 　 二次元電泳操作方法  　
　 　 　 Two-Dimensional Electrophoresis (2-DE) Protocol  　
　 　 　   　
　 　 　

　
　 　 　 　 　
　 　 　  上課公告   　
　 　 　

(1) 2011 年 7/11 實驗開始上課，課程內容大致不變，但時間及進度有點改變。

 　
　 　 　

(2) 7/11 週一 14:00 準時在生化科技學系 (農化二館) 二樓實驗室上課。  地圖

　
　 　 　

(3) 請自攜帶 實驗衣、筆記本 (筆記方法)、飲用水，上課講義當場發送 (或先下載)。

 　
　 　 　
　
　 　 　

教師：莊榮輝、陳翰民 (輔仁大學生命科學系)

 　
　 　 　      另聘請校外及產業界講員 　
　 　 　

 

　
　 　 　

助教：   林怡岑                    施驊珊                  楊己任

 　
　 　 　   　
　 　 　     (台大生科院 生技系博士班)   　
　 　 　
　
　 　 　 　 　
　 　 　   目 錄：

外部連結

 　
　 　 　

2010 年講義

   Pharmacia (GE): Proteomics 　
　 　 　

P1) Sample preparation 

Right from the start ( pdf )

 　
　 　 　

P2) 2-D electrophoresis

2-D electrophoresis ( pdf ):

 　
　 　 　

P3) In-gel digestion

    └ IPGphor 3 ( pdf ): User Manual ( pdf )

 　
　 　 　

P4) Western transfer and immunostaining

    └ 2nd dimension

　
　 　 　

P5) Protein sequencing by Edman degradation

Applied Biosystem: AB492 Procise ( pdf )

 　
　 　 　

P6) Protein sequencing by LC/MS/MS

　

 　
　 　 　

P7) Protein sequence analysis

　

 　
　 　 　

P8) Differential fluorescence labeling

DIGE ( pdf ); CyDyeDIGE ( pdf )

 　
　 　 　 　

　

 　
　 　 　 　 　 　
　 　 　    2011 年講義   pdf   其他講義下載

 詳細時刻表  

　
　 　 　
　
　 　 　 　 　
　 　 　 實驗流程： 　
　 　 　 　 　
　 　 　

本實驗課以二次元電泳為主幹，將蛋白質體在電泳膠片分開來之後，分別進行三種重要的分析工作：(X) LC-MS/MS 分析 (Y) Edman degradation 蛋白質定序 (Z) 免疫轉印。所獲得的結果，對蛋白質體中各組成蛋白質的身分鑑定，有極為關鍵性的參考價值。下面流程圖分別標明 X, Y, Z 三條實驗主軸，另外可能的話，將示範 Cy3 + Cy5 DIGE 系統的螢光染色比對法，可更清楚地看出兩種樣本內蛋白質體的差異。

 　
　 　 　 　 　
　 　 　 　
　 　 　

 

 　
　 　 　

▼ 注意：

 　
　 　 　

(1) 在本實驗課中，你總共要做 3 次二次元電泳，請好好把握學習。

 　
　 　 　

(2) 請好好記錄下實驗操作流程，實驗記錄方式請參考 實驗之路。

 　
　 　 　

(3) 所有結果也必須整理出來，將有兩次口頭報告，請參考 One-Page Show。

 　
　 　 　

 詳細時刻表  

　
　 　 　
　
　 　 　

2009 年度

 　
　 　 　

年度報告最佳投影片： 1st week,  2nd week (三組)

 　
　 　 　
　
　 　 　

2008 年度 課後學生評鑑：4.35 (學校電腦評鑑)

 　
　 　 　
　
　 　 　

2007 年度 課後學生評鑑：4.80 (生技中心紙本評鑑)

 　
　 　 　

　
　 　 　

2007 年報告最佳投影片： B1 (1st week),  B2 (2nd week)

 　
　 　 　
　
　 　 　

2006 年度 (課後學生評鑑：4.85)

 　
　 　 　

　
　 　 　
　
　 　 　

2005 年度 (課後學生評鑑：4.8)

 　
　 　 　

2005 年報告最佳投影片： B1 組

 　
　 　 　
　
　 　 　

2004 年度課程照片 (課後學生評鑑：4.7)

 　
　 　 　

　
　 　 　

2004 年報告最佳投影片： B2 組

 　
　 　 　
　
　 　 　

2003 年度課程照片 (期末學生評鑑：4.78)

 　
　 　 　

　
　 　 　

2003 年報告最佳投影片： C2 組

 　
　 　 　
　
　 　 　

 Linkings:

　
　 　 　

實驗課講義： 莊榮輝 proteomics 2010.pdf

 　
　 　 　

上課投影片： 陳翰民 (1) Introduction to modern proteomics, (2) 2-DE 及樣本製備

 　
　 　 　

演講投影片： 劉俊昇 (2010) 生技產業與質譜應用的發展趨勢

 　
　 　 　

演講投影片： 王淑芝 (2010) Introduction to mass spectrometry based proteomics

 　
　 　 　

演講投影片： 蔡沛倫 (2011/07/21) Mascot introduction and application

 　
　 　 　 　 　
　 　 　

▼以下僅供參考，非本課程講義：

 　
　 　 　

酵素化學實驗：蛋白質科技  二次元電泳 

　
　 　 　

動畫檔案：(1) ESI (Bruker)、(2) Protein chip、(3) MALDI、(4) Reflector  (Ciphergen)

 　
　 　 　
　
　 　 　

◆ 台大生科院 生化科技學系  莊榮輝 (課程表)  3366-4448 或 e-mail: juang@.ntu.edu.tw

 　
　 　 　

　
　 　 　

更新日期： 2011/07/15

 　
　 　 　

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