酵素化學實驗 B3 酵素操作方法 1 分析 2 純化 3 電泳 4 轉印 | |||||||||||||||||||||||||||||
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等電焦集法: |
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等電焦集法 是根據蛋白質的 pI 進行分離。當樣本蛋白質在含有 ampholyte 的聚丙烯醯胺中泳動時,ampholyte 會自動形成一 pH 梯度;當蛋白質的 pI 低於環境 pH 時,其淨電荷為負,因此會往正極泳動;而當環境 pH 與此蛋白質 pI 相同時,淨電荷變為零而不泳動,且焦集在膠體中。 與已知 pI 的標準蛋白質樣本比較,即可得知此樣本蛋白質的 pI。 以下所述方法,是在直立式平板電泳系統 (Novex) 進行的,若要進行 二次元電泳,則須使用柱狀膠體,Hoefer SE-250 另配備有此種套組。Pharmacia 最新開發的 IPGphor 也是等電焦集,可以進一步用在二次元電泳。 |
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儀器: |
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電源供應器 |
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試劑: |
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負極緩衝液 (cathode buffer, 10×): |
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正極緩衝液 (anode buffer, 50×): |
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樣本緩衝液 (2×): |
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固定液 (5×): |
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標準 pI 蛋白質組合 (Pharmacia broad pI calibration kit): |
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方法: |
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(1) 將樣本與樣本緩衝液以 1:1 混合,通常樣本中的鹽濃度在 10~20 mM 間最適合,若鹽濃度太高則會影響電泳的結果。 |
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(2) 將 10× 的負極緩衝液稀釋至 1×,並確定正確的 pH 值。利用超音波震盪抽氣以去除氣泡,以減少在電泳過程中出現的二氧化碳,在電泳槽的上槽加入適當量的緩衝液。 |
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(3) 將 50× 的正極緩衝液稀釋至 1×,確定 pH 值正確後加入電泳槽的下槽。 |
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(4) 小心注入已混合均勻的樣本。 |
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(5) 依照下面的條件,進行電泳: |
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100 V (1 h) → 200 V (1 h) → 500 V (30 min) |
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(6) 電泳完畢後,打開膠體卡匣,將膠體浸入固定液中 30 min 固定蛋白質,並洗去 ampholyte,若 ampholyte 未洗淨會造成膠體染色背景過深。 |
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(7) 以所要的染色方法對膠體進行染色。 |
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酵素化學實驗 B3 酵素操作方法 1 分析 2 純化 3 電泳 4 轉印 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
膠體染色法: |
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3.5.1 Coomassie Brilliant Blue R (CBR) 染色法: |
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CBR 染色法 是利用藍色 CBR 分子上的芳香苯環,與蛋白質的疏水區結合;同時其亞硫酸基團 (-SO32-) 與蛋白質的正電荷結合,可使蛋白質染出藍色色帶。是非常方便的蛋白質染色法,但其靈敏度不高,每個色帶至少要有數十 mg 以上的蛋白質才染得清楚。 |
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儀器: |
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平台震盪器 |
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染色缸: 最好用玻璃製品,Corning 廚具的長方形玻璃缸極為合用。 |
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試劑: |
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CBR 染色液: |
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CBR 脫色液: |
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10% 醋酸與 20% 甲醇的水溶液。 |
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方法: |
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(1) 將電泳完畢的膠體浸入 CBR 染色液中,染色液用量只要蓋過膠片即可;置於平台震盪器上搖盪 30 min。 |
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(2) 倒出染色液,用自來水沖洗後倒入脫色液,脫色液蓋過膠片即可。 於染色缸中放入一塊吸水紙,可加速脫色過程。 |
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(3) 若蛋白質濃度較低,則染色時間可加長 (1 h) 以增加色帶深度。 |
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(4) 若膠體表面有不溶的 CBR 染料沈積,可以用 50% 甲醇洗去。 |
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3.5.2 硝酸銀染色法: |
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硝酸銀染色 是一種靈敏度極高的蛋白質染色法,靈敏度可達 CBR 染色的百倍以上。 蛋白質分子上的酸基 (COO-) 會與銀銨錯離子結合,而銀離子在酸性環境中被還原為金屬銀,可使蛋白質色帶呈現深棕至黑色。本染色法增加了還原液甲,藉由其中的戊二醛 (glutaraldehyde) 與蛋白質分子上的胺基 (Lys 或 Arg) 耦合,而增加銀離子的結合基團,使得靈敏度更增。硝酸銀染色的成敗決定於所使用的藥品品質,試劑的製備必須使用 Milli-Q 或同等級的水。 |
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儀器: |
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平台震盪器、玻璃染色缸 |
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試劑: |
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還原液甲: |
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還原液乙: |
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硝酸銀液: |
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反應中止液: |
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矽化液: |
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Dichlorodimethylsilane 5% (Fluka) 的氯仿溶液。 |
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◆ 注意矽化液揮發性強且具毒性,要帶手套在排煙櫃中操作。 |
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方法: |
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(1) 先將玻璃染缸表面做矽化,目的是防止硝酸銀液反應後,膠片黏在缸上,造成取出時膠片破裂。 |
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◆ 矽化需戴雙層手套,因矽化物及氯仿具有毒性且會溶解手套。 |
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(2) 電泳後,膠片放至玻璃染缸中,以 50% 甲醇洗三次,每次至少 10 min。 |
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◆ 經 CBR 染色過的膠片,若有些色帶無法出現,可在脫色完畢後,接到此一步驟進行硝酸銀染色,以利進一步觀察。 |
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(3) 倒去甲醇,用水洗三次,每次 10 min。 |
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(4) 加入還原液甲,反應 1 h。 |
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(5) 倒去還原液甲,用水洗 3~5 次,每次 10 min。 |
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(6) 加入硝酸銀溶液,反應 10 min。 |
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(7) 倒去硝酸銀液,用水洗 3~5 次,每次 10 min。 |
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(8) 加入還原液乙,開始呈色,在背景顏色未加深前倒去還原液乙。 |
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(9) 用水洗過膠片後,馬上加入反應中止液,約 1 h 後,可進行膠片乾燥。 |
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(10) 若染色後背景顏色過深,可以利用硫代硫酸鈉溶液或者定影液洗過夜,則可重新染色。 |
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硝酸銀染色是一種靈敏度極高的蛋白質染色法,而且也可以用來染蛋白質分子上的醣類。 醣類的雙醇基 (diol) 可用過碘酸氧化為醛基 (-CHO),因而可與銀銨錯離子結合;此染色法可以檢定蛋白質是否為醣蛋白,靈敏度比 Schiff 法要高。但由於蛋白質本身也會呈色,因此在染色過程中必須在同一片膠體上加有 positive control (使用 glycoprotein, IgG) 與 negative control (如 BSA),在 negative control 尚未呈色前,所染得的色帶才是醣蛋白。 |
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儀器及試劑: |
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儀器及硝酸銀等試劑同上節,另需下列各藥品: |
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固定液 A: |
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10% 醋酸 (Wako) 及 25% 異丙醇 (Merck) 的混合溶液。 |
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固定液 B: |
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7.5% 醋酸 (Wako) 溶液。 |
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過碘酸溶液: |
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還原液乙: |
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方法: |
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(1) 先將染缸表面做矽化處理,目的是防止硝酸銀液反應後,膠片黏在缸上,容易造成取出時膠片破裂。 |
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(2) 電泳後,膠片放至玻璃缸中,以固定液 A 固定過夜。 |
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(3) 隔日改以固定液 B 浸泡 30 min。 |
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(4) 倒去固定液 B,加入過碘酸溶液於 4℃反應 1 h。 |
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(5) 倒去過碘酸溶液,用水洗 3~5 次,整個過程共 3 h。 |
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(6) 加入硝酸銀溶液,反應 10 min。 |
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(7) 倒去硝酸銀液,用水洗 3~5 次,每次 10 min。 |
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(8) 加入還原液乙開始呈色,觀察 negative control 的蛋白質是否呈色,在其未呈色前倒去還原液乙。 |
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(9) 用水洗過膠片後,馬上加入反應中止液,約 1 h 後,可進行膠片乾燥。 |
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(10) 若染色後背景顏色過深,可以利用硫代硫酸鈉溶液或者定影液洗過夜,則可重新染色。 |
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原態電泳後的膠片若浸入含有酵素基質的反應液中,則待酵素反應呈色後,可得知酵素泳動率以及其活性強弱;但酵素所生成的產物必須是水不溶性,才能在膠片中聚集呈色。 澱粉磷解脢在含有 Glc-1-P 的環境下,可進行葡聚醣的延長反應,產生不可溶的直鏈澱粉,然後以碘液使澱粉染上紅棕至深紫色。此法偵測磷解脢的活性極為靈敏,但會受雜夾在樣本中 b-amylase 的干擾。 |
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儀器: |
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平台震盪器、恆溫箱 (37℃) |
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試劑: |
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MES 緩衝液 (0.04 M, pH 5.9): |
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Glc-1-P (32 mM): |
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可溶性澱粉 (1.2%): |
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碘液呈色劑: |
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方法: |
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(1) 將原態電泳完畢的膠體置於基質液中,其中 MES : Glc-1-P : soluble starch = 2:1:1 (體積比);基質液用量只要蓋過膠片即可。 |
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(2) 於 37℃ 中反應適當的時間,1~2 mg 的 SP 在含有醣引子下,反應 2 h 可染出清楚色帶,不含醣引子則約需 18~24 h。 |
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(3) 反應完成後,可以看到白色的澱粉色帶出現。倒去基質液,以蒸餾水清洗膠片數次,加入碘液蓋過膠片以呈色,並且震盪使呈色均勻。 |
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(4) 此時可看見碘呈色色帶:含有澱粉引子的膠片,其背景顏色較深;可在蒸餾水中清洗,以洗去多餘的可溶性澱粉基質;若色帶因碘昇華而消失,可以再加入碘液重染一次。 |
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(5) 若樣本中含有澱粉脢 (如 b-amylase),則在含澱粉的膠片上出現反白色帶,會影響磷解脢的呈色。為了避免這種影響,在電泳完畢後,可將膠片先浸於 100 mM HgCl2 溶液中 3~5 min 後洗去,以抑制澱粉脢的活性。 |
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酵素化學實驗 B3 酵素操作方法 1 分析 2 純化 3 電泳 4 轉印 | |||
膠片乾燥法: |
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利用玻璃紙 (賽路芬 cellophane) 的半透膜特性,電泳膠片中的水分及甲醇在三明治組合中會滲透而蒸發,使得膠片被壓乾且壓平於兩張玻璃紙中,可以長久保存。膠片乾燥後亦可做同位素放射顯像,或者色帶濃度掃描。 |
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用具: |
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玻璃板、玻璃紙、文書夾 |
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方法: (如 下圖) |
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(1) 在玻璃板上鋪平第一張溼潤的玻璃紙 (A),玻璃紙的四邊要略大於玻璃板,四邊折下,避免玻璃紙與玻璃板中有任何的氣泡產生。 |
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(2) 將染色完畢之膠片置於上述步驟之玻璃紙上 (B)。 |
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(3) 將另外一張玻璃紙浸溼,小心鋪蓋於膠片上,避免任何氣泡產生 (C),玻璃紙的四邊要略大於玻璃板約 1~2 cm,將第二層的玻璃紙四邊反摺到玻璃板背面 (D)。 |
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(4) 以文書夾夾住四角,置於室溫或 37℃ 烘箱中乾燥 (E),也可以電扇吹風。 |
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(5) 檢查膠片是否完全乾燥,可以利用指甲在膠片上輕敲,乾燥完全的膠片不會留下任何指甲痕跡;可將膠片剪下,以護貝膠膜護貝後保存。 |
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建立日期:2001/4/21 更新日期:2002/07/27 © 版權所有