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生化共同儀器 |
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計畫內容 儀器說明 使用申請 | |
O-2D-2 AB 492 |
服務說明 如何計費 申請方法 注意事項 |
計畫目標 實驗室說明 使用申請表格 營運現況 | |
請注意: 收取費用調漲 |
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目前完成定序案件總數:356 |
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自 2003 年 6 月開始服務 統計日期:2008/12/10 |
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服務說明: |
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本儀器由台灣大學跨院系貴重儀器經費 (2002 年) 所購置,除協助本系或校內各研究室進行相關的蛋白質序列分析之外,若儀器仍有多餘產能,將可提供為校外各研究單位定序服務。 至此,把我們所有的研究服務項目整合起來,已經達到若干年前的一個理想,就是完成整個蛋白質的『純化 - 檢定 - 定序 - 抗體』流程,以支援相關的教學與研究。在『蛋白質體學』正方興起的此時此刻,更具有水到渠成的意義,也正是順應潮流與需求。 |
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儀器型號: Applied Biosystems, Procise 492 |
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根基於 Edman degradation 反應的傳統 N-端自動定序儀器。 |
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參考網站:Max Plank Institute for Molecular Genetics: Edman Sequencing |
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如何計費: |
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因為本儀器的消耗品及維護費相當昂貴,因此請使用者共同負擔費用,以便維持儀器的良好操作品質。 |
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請特別注意 |
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因為定序結果不一定成功,可能樣本太雜,或 N-端被 blocked;雖然無法完成定序,仍須付『基本費用』是我們服務的先決條件。若無法認同這一點,請勿送件。(通常遇到無法定序的樣本,我們都會跑一次標準品,看系統是否有問題,確定系統正常,才會決定是被 blocked)。 |
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經過三年服務之統計,若不計入儀器購置、水電人工等成本,向大家收取的費用,無法支付本儀器的消耗品費用,因此 2007 年起調漲費用如下︰ |
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收費說明: |
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(1) 數量增加享有折扣優待,是因為較大數量一起處理起來比較方便,因此必須是 同一批送件 才能有折扣,否則仍以單件計價。 |
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(2) 例如只送一件,定出十個胺基酸,則需付費 1,800 + (250 x 10) = 4,300。 |
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(3) 因為我們無法開立發票,因此 將由相關廠商開出所使用試劑或維修費用的發票,由使用者報銷。我們只希望自給自足,沒有營利的計畫。 |
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(4) 因故未能定出序列者,除非是我們操作失誤,也必須收取基本費用。 |
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申請方法: |
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請以 e-mail 提出服務要求,先複製並填妥以下各資料或問題: |
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或者 下載申請書 (MS Word file) |
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基本資料: (必須回答) 計畫主持人: 姓名 連絡電話 (通常是指導教授) 計畫執行人: 姓名 連絡電話 (通常是研究生、博士後或助理) 樣本總數目: 請注意要同一批送件 樣本的來源: 請分別說明每一個樣本的來源為何 樣本的純度: 請說明如何純化或得到你的樣本 以下這些說明可以幫助我們處理樣本: (選擇性回答) 樣本的處理: 樣本有沒有經過特別的處理 (例如蛋白脢水解片段) 最多循環數: 例如指定最多只要定十個胺基酸 (或沒有限制) 電泳染色片: 電泳片的結果可以幫助我們操作更正確 樣本之定量: 有無蛋白質定量結果 其它注意事項: 要不要快速 e-mail 通知定序結果? |
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若你的樣本數目很多,也可以使用如下的表格: (請自行修改格式或內容) |
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請電郵至: juang@ntu.edu.tw 電話:(02)3366-4081 賈儒珍 |
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技術問題請洽: 賈儒珍 (02)3366-4081 |
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樣本郵寄: 台北市羅斯福路四段 台灣大學 農化二館 AC2-520 莊榮輝 收 |
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注意事項: |
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樣本的準備方法: |
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(1) 要求三個基本原則:質均、量多、少鹽類。 |
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(2) 原則上只接受 轉印在 PVDF 膜 上的樣本,其它形式樣本請來信洽詢。 |
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參考:轉印 PVDF 膜的操作方法 (酵素化學實驗)。 |
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(3) 樣本濃度越高越好,Coomassie Blue 染色要能清楚看到 (1~10 mg),請自行調整;可集合若干個相同樣本,一起送來定序,結果會較明顯。 |
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參考:如刊頭 二次元電泳圖片 中所標示的蛋白質色點最為理想。 |
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(4) 最好的樣本是由 二次元電泳 轉印所得,若是使用一次元電泳,就要小心有無污染,電泳前儘量以各種色層分析法預先純化。 |
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(5) 樣本中避免使用 Tris 為緩衝液,也要去除任何含有 自由胺基 的添加物。 |
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注意:若因樣本太雜或上述問題導致無法定序,請使用者自行負責。 |
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(6) 若遇到 N-端 blocking 的問題,將馬上通知使用者,以便儘快處理。 |
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對策:若 N-端 blocked 就要以蛋白脢水解,分離出胜汰片段來定序;或可改用 LC-MS-MS 質譜儀分析,則請另覓相關貴儀服務。 |
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注意:很對不起,但 N-端 blocking 也要收取基本費用。 |
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送件排序原則: |
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(2) 依樣本送到的先後順序排隊上機,若前面樣本很多,就要排隊較久。 |
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(3) 在本網頁刊頭處標出最近的 樣本排隊數目,請自斟酌等候時間。 |
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(4) 若有急件須插隊者,請來電洽詢能否安排,急件需提高 基本費用五成。 |
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(5) 我們希望大部分樣本都能夠在一週內完成定序工作。 |
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(6) 目前僅接受 學術單位 委託,尤其是各公私立大學及研究所。 |
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結果報告: |
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(1) 將以限時掛號寄上預測的蛋白質序列,以及每一循環的 HPLC 圖譜。 |
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(2) 若需快速通知定序結果,將先以 e-mail 告知序列,同時再郵寄結果。 |
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(3) 因故未能定出序列者,我們將說明理由,並且與使用者洽商對策。 |
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(4) 遇有糾紛 很難免的,當你的序列定不出來,或結果不符合預期時,一定不太高興;此時我們會檢查其他人的定序是否正常,並通知此一事實;若無他人的樣本對照時,我們會跑一次標準品。請記得,你樣本處理越好,定序成功的機率就越大,所得到的序列也會越長。 申訴電話:3366-4448 莊榮輝。 |
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預祝各位 實驗順利、研究成功! |
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本儀器已加入生命科學院的 TechComm 服務網 |
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內部使用登記表 [LOG88.doc]
網頁建立日期:2003/05/11 最近更新日期: 2008/12/10