生化共同儀器

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O-2D-1 FPLC

計畫內容   儀器說明   使用申請

O-2D-2 AB 492

服務說明   如何計費   申請方法   注意事項

O-3B Ab

計畫目標   實驗室說明   使用申請表格   營運現況
 

News letter

O-2D-2

     

請注意: 收取費用調漲

目前完成定序案件總數:356

2003 6 月開始服務  統計日期:2008/12/10

請注意:自 2007 4 月起加入生科院 TechComm 服務 (P4-A40) 以下資料可能不正確

 

       
   

服務說明

 
       
   

        本儀器由台灣大學跨院系貴重儀器經費 (2002 年) 所購置,除協助本系或校內各研究室進行相關的蛋白質序列分析之外,若儀器仍有多餘產能,將可提供為校外各研究單位定序服務。 至此,把我們所有的研究服務項目整合起來,已經達到若干年前的一個理想,就是完成整個蛋白質的『純化 - 檢定 - 定序 - 抗體』流程,以支援相關的教學與研究。在『蛋白質體學』正方興起的此時此刻,更具有水到渠成的意義,也正是順應潮流與需求。

 
       
   

儀器型號: Applied Biosystems, Procise 492

 
   

 
   

根基於 Edman degradation 反應的傳統 N-端自動定序儀器。

 
   

參考網站:Max Plank Institute for Molecular Genetics: Edman Sequencing

 
       
   

儀器位置: 台大生命科學院 微生物與生化所 mbc 生化共同儀器室 (Pub C)

 
       
   
 
       
   

如何計費

 
       
   

        因為本儀器的消耗品及維護費相當昂貴,因此請使用者共同負擔費用,以便維持儀器的良好操作品質。

 
       
   

 請特別注意

 
   

因為定序結果不一定成功,可能樣本太雜,或 N-端被 blocked;雖然無法完成定序,仍須付『基本費用』是我們服務的先決條件。若無法認同這一點,請勿送件。(通常遇到無法定序的樣本,我們都會跑一次標準品,看系統是否有問題,確定系統正常,才會決定是被 blocked)。

 
       
   

經過三年服務之統計,若不計入儀器購置、水電人工等成本,向大家收取的費用,無法支付本儀器的消耗品費用,因此 2007 年起調漲費用如下︰

 
   
樣本數目 1~2 3~5 6~9 10 以上  
基本費用

1,800

1,700

1600

1500

無論有無定出序列均得繳付

每胺基酸

250

250

250

250

依最後定出的胺基酸數目計算

         

 

         

 

 
   

收費說明:

 
   

(1) 數量增加享有折扣優待,是因為較大數量一起處理起來比較方便,因此必須是 同一批送件 才能有折扣,否則仍以單件計價。

 
   

(2) 例如只送一件,定出十個胺基酸,則需付費 1,800 + (250 x 10) =  4,300

 
   

(3) 因為我們無法開立發票,因此 將由相關廠商開出所使用試劑或維修費用的發票,由使用者報銷。我們只希望自給自足,沒有營利的計畫。

 
   

(4) 因故未能定出序列者,除非是我們操作失誤,也必須收取基本費用

 
       
   
 
       
   

申請方法

 
       
   

請以 e-mail 提出服務要求,先複製並填妥以下各資料或問題:

 
   

或者 下載申請書 (MS Word file)

 
       
   

基本資料: (必須回答)

計畫主持人: 姓名  連絡電話  (通常是指導教授)

計畫執行人: 姓名  連絡電話  (通常是研究生、博士後或助理)

樣本總數目: 請注意要同一批送件

樣本的來源: 請分別說明每一個樣本的來源為何

樣本的純度: 請說明如何純化或得到你的樣本

以下這些說明可以幫助我們處理樣本: (選擇性回答)

樣本的處理: 樣本有沒有經過特別的處理 (例如蛋白脢水解片段)

最多循環數: 例如指定最多只要定十個胺基酸 (或沒有限制)

電泳染色片: 電泳片的結果可以幫助我們操作更正確

樣本之定量: 有無蛋白質定量結果

其它注意事項: 要不要快速 e-mail 通知定序結果?

 
       
   

若你的樣本數目很多,也可以使用如下的表格: (請自行修改格式或內容)

 
   
樣本名稱 樣本來源 樣本純度 循環數 其它說明

 1

       

 2

       

 3

       

 4

       

 5

       

 6

       

 7

       

 8

       

 9

       

10

       
 
   

連 絡

 
   

請電郵至: juang@ntu.edu.tw  電話:(02)3366-4081 賈儒珍  

 
   

技術問題請洽: 賈儒珍 (02)3366-4081

 
   

樣本郵寄: 台北市羅斯福路四段 台灣大學 農化二館 AC2-520 莊榮輝 收

 
       
   
 
       
   

注意事項

 
       
   

樣本的準備方法: 

 
   

(1) 要求三個基本原則:質均量多少鹽類

 
   

(2) 原則上只接受 轉印在 PVDF 膜 上的樣本,其它形式樣本請來信洽詢。

 
   

參考:轉印 PVDF 膜的操作方法 (酵素化學實驗)。

 
   

注意:請一定使用 MilliporePVDF 膜,以免轉印膜溶解掉。

 
   

(3) 樣本濃度越高越好,Coomassie Blue 染色要能清楚看到 (1~10 mg),請自行調整;可集合若干個相同樣本,一起送來定序,結果會較明顯。

 
   

參考:如刊頭 二次元電泳圖片 中所標示的蛋白質色點最為理想。

 
   

(4) 最好的樣本是由 二次元電泳 轉印所得,若是使用一次元電泳,就要小心有無污染,電泳前儘量以各種色層分析法預先純化。

 
   

(5) 樣本中避免使用 Tris 為緩衝液,也要去除任何含有 自由胺基 的添加物。

 
   

注意:若因樣本太雜或上述問題導致無法定序,請使用者自行負責。

 
   

(6) 若遇到 N-端 blocking 的問題,將馬上通知使用者,以便儘快處理。

 
   

對策:若 N-端 blocked 就要以蛋白脢水解,分離出胜汰片段來定序;或可改用 LC-MS-MS 質譜儀分析,則請另覓相關貴儀服務。

 
   

注意:很對不起,但 N-端 blocking 也要收取基本費用。

 
       
   

送件排序原則:

 
   

(1) 樣本請以掛號郵寄 上述地址,或者親送 本實驗室

 
   

(2) 依樣本送到的先後順序排隊上機,若前面樣本很多,就要排隊較久。

 
   

(3) 在本網頁刊頭處標出最近的 樣本排隊數目,請自斟酌等候時間。

 
   

(4) 若有急件須插隊者,請來電洽詢能否安排,急件需提高 基本費用五成

 
   

(5) 我們希望大部分樣本都能夠在一週內完成定序工作。

 
   

(6) 目前僅接受 學術單位 委託,尤其是各公私立大學及研究所。

 
       
   

結果報告

 
   

(1) 將以限時掛號寄上預測的蛋白質序列,以及每一循環的 HPLC 圖譜。

 
   

(2) 若需快速通知定序結果,將先以 e-mail 告知序列,同時再郵寄結果。

 
   

(3) 因故未能定出序列者,我們將說明理由,並且與使用者洽商對策。

 
   

(4)  遇有糾紛  很難免的,當你的序列定不出來,或結果不符合預期時,一定不太高興;此時我們會檢查其他人的定序是否正常,並通知此一事實;若無他人的樣本對照時,我們會跑一次標準品。請記得,你樣本處理越好,定序成功的機率就越大,所得到的序列也會越長。 申訴電話:3366-4448 莊榮輝。

 
       
   

預祝各位 實驗順利、研究成功!

 
   

 
   

 本儀器已加入生命科學院的 TechComm 服務網

 
   
 

內部使用登記表 [LOG88.doc]

網頁建立日期:2003/05/11   最近更新日期: 2008/12/10