▲ 到首頁 ▲ 到第四章首 ▲ 接續 4.1.4 節 ▲
|
||
蛋白質檢定方法 |
蛋白質定量分析 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bradford 的 dye-binding method 是利用 Coomassie brilliant blue G-250 (CBG) 可與蛋白質結合而 變色 的特性來定量 (Bradford, 1976);若試樣中的蛋白質量較多,則結合到蛋白質而變色的 CBG 也多,因而呈色較深。下例是以一組標準蛋白質為對象,製作一條蛋白質量與吸光度的標準校正線。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
儀器用具: |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ELISA 光度計 (Dynatech MRX) 可在一分鐘內測完一片滴定盤 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Micro test tubes, 大頭針或噴火槍 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
藥品試劑: |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(a) Buffer A-0 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(b) BSA 標準品 (Bio-Rad, bovine serum albumin, 100 mg/mL) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(c) 未知濃度樣本 (unknown BSA, 0.8 mL, 由教師調配發給) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
u以染料 Coomassie brilliant blue G-250 配製的溶液,勿與 膠體電泳染色 用的 CBR-250 混淆,各有其使用上的特色,不要互用。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
標準品及樣本: |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
使用小試管準備一組 BSA (b) 標準品的系列稀釋: |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
u配製一定要精準,否則校正直線不會很準確;各種試劑的添加,若 自稀往濃 取樣,則可以不用換吸管頭。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
未知樣本: |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
再以上述 unknown BSA (c) 準備兩種未知樣本: |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
一般樣本: |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1) 通常由色析法所收集到的各分劃樣本,都可以直接進行蛋白質定量分析;但若其中含有某些干擾因子 (如含有 Triton ),或樣本的濃度太濃,都必須將樣本稀釋後再測。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2) 同一樣本的若干不同稀釋濃度,所測出來的最終蛋白質濃度會有差異,通常是以 稀釋度大者 較為準確。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方法步驟: |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1) 每槽先加好 50 mL 標準品 (#0, #1 .... #5) 或未知樣本 (X1, X2),以 二重複 加入 96 孔滴定盤中,如圖 4.3 所示。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
F4.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
圖 4.3 微量滴定盤的使用 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2) 每槽再加入200 mL Dye-Reagent (d),在全部樣本槽加完前,不要中斷添加;同時小心避免氣泡產生。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
u本步驟是實驗成敗的關鍵! |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3) 輕拍滴定盤一側,使添加的各成份均勻混合,注意 Dye-Reagent 密度較大,很容易沉積在下方而分層。 若還有小氣泡,小心以大頭針刺破,大量時可用噴火槍火燄燒破。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4) 靜置室溫 10 min。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5) 以 ELISA reader 測量 570 nm (或 595 nm) 的吸光值。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
註解討論: |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
a. 在作圖紙上畫出標準品的校正線,並決定未知樣本的濃度 (如圖 4.4 )。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
b. 請說明本分析方法的原理,並特別以蛋白質構造來說明。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
c. 一般緩衝液或試劑中,何種添加物會影響 Bradford 法的呈色? |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
d. 請列出本分析方法的各操作步驟中,哪些會影響分析的準確度? |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
e. 還有哪些蛋白質的定量方法? 並請比較其優劣點。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
F4.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
圖 4.4 繪製標準品校正線 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
酵素活性分析法 |
|||||||||||||||||
表現出來的酵素 GUS 可以水解其基質衍生物 pNPG,所產生的 黃色 生成物 p-nitrophenol,可供活性測定 (Jefferson et al, 1986); 催化反應如下式: |
|||||||||||||||||
儀器用具: |
|||||||||||||||||
ELISA 光度計 (Dynatech MRX) |
|||||||||||||||||
藥品試劑: |
|||||||||||||||||
基質溶液 (GUS reaction buffer): |
|||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||
終止液 (stop buffer): 2.5 M 2-amino-2-methyl propanediol (Sigma A-9754) |
|||||||||||||||||
方法步驟: |
|||||||||||||||||
1) 吸取 20 mL 的蛋白質樣本,小心注入微量滴定盤中,避免氣泡產生。 |
|||||||||||||||||
2) 每一樣品槽加入 200 mL 基質液,混合均勻;可用燒熱的接種環去除氣泡。 |
|||||||||||||||||
3) 靜置約 1~2 min,顏色開始加深,然後加入 30 mL 終止液。 反應時間的長短,要以樣本中的酵素活性大小來做調整。因為我們只測定色析法各分劃的相對酵素活性,因此並不加終止液。 |
|||||||||||||||||
4) 以 ELISA 光度計測定波長 415 nm 之吸光值。 |
|||||||||||||||||
酵素活性單位的測定: |
|||||||||||||||||
a. 以上步驟,只可測定 GUS 活性的相對大小,對色析法所得到的各個分劃進行偵測,相當方便,但並非酵素絕對活性單位的測定方法。 |
|||||||||||||||||
b. 若要測定酵素的 絕對活性單位,要使用最適當的酵素用量,使酵素在反應一段固定的時間後,其生成物的呈色吸光度,落在光度計的可測範圍之內;然後計算此段時間內,每分鐘所產生的吸光度增加量,轉換成生成物的莫耳數,即可求得其真正的活性單位。 |
|||||||||||||||||
c. 因此酵素的 活性單位 定義為:每分鐘所能催化生成物之 mmole 數。 |
|||||||||||||||||
註解討論: |
|||||||||||||||||
a. 實驗之前先規畫好各樣本在滴定盤上的分佈位置,並做好標示。 |
|||||||||||||||||
b. 以微量滴定盤進行活性測定時,能否使得每一槽的反應時間一致? |
|||||||||||||||||
c. 化學反應最重要的操作要點之一,是要使所加入的各種成份均勻混合,在使用微量滴定盤時,你如何使所加的液體混合均勻? |
|||||||||||||||||
|
膠体電泳法 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
電泳 的高解析力使其成為生化技術中最有效力的一門分析利器,以下簡略說明各種電泳的形式及其應用。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
a. 不連續膠體電泳 (disc-PAGE) 是以原態蛋白質進行電泳,一般用作純度檢定或活性分析,SDS-膠體電泳 (SDS-PAGE) 則用為 次體分子量 之測定,梯度 (gradient) 電泳則可輔助原態蛋白質分子量之決定。 結合 SDS 及梯度兩種特性的 SDS-梯度膠體電泳,其解析力最高。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
b. 電泳形式 早期使用圓柱狀膠體,演變成直立式的平板膠片 (16 × 18 cm),最後改成迷你電泳膠片 (8 × 10 cm),電泳時間只約一小時,而其解析力不變。現在柱狀膠體電泳只用在等電焦集法,以進行二次元電泳;而大型平板電泳則多用在製備式電泳,一般電泳大多以迷你膠片進行之。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
c. 膠體材質 的種類很多,但用在蛋白質者則以 聚丙烯醯胺 (polyacrylamide) 為主;聚丙烯醯胺電泳是蛋白質應用最廣的電泳分析方式。也有少數使用洋菜膠體 (agarose gel),多用在測定 pI 較廣的異構脢酵素群。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
d. 泳動率: 在 pH 8.8 的電泳條件下,大部分 pI 小於 8.8 的分子均能往正極泳動;蛋白質的泳動率與所帶電荷成正比,而與其分子量成反比;若分子量一樣,但形狀越不規則,或體積越鬆散者,泳動率越小。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
e. SDS 電泳 雖然分有原態的 disc- 及變性的 SDS-PAGE 兩種,但兩者除了 SDS-PAGE 在整個系統含有 0.1% SDS 之外,其餘完全相同,且其鑄膠及電泳方法均屬大同小異。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
f. 原態 disc-PAGE 中的樣本蛋白質,因電泳系統中不含界面活性劑 SDS,其活性多能保持,可以在膠體上做活性染色。 若目標酵素沒有方便的活性染色法,則可把膠體一片一片切下,做每一片膠體的活性測定。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
儀器用具: |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
鑄膠器 (Hoefer SE 245 可鑄造兩片迷你膠片) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
鑄膠三明治組合: (每一片膠片) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
電泳樣本專用微量吸管頭 (尖端較長且扁) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
供電器 (可供應 200 V 電壓及 500 mA 電流者均可使用) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
塑膠染色盒 (比膠片稍大且要能密蓋) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
旋轉搖盪器 (rotary shaker) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
看片箱 (light box) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
護貝機及護貝膜 (可護貝如膠片大小者) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
膠片乾燥組合: |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(1) 玻璃板 (至少要比膠片大,約 12 × 15 cm,厚度約 3~4 mm) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(2) 玻璃紙 (Cellophane, 年糕紙,比上面玻璃板每邊多出 5 cm 以上) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
以下聚丙烯醯胺膠體電泳所使用的試劑及方法乃根據 Laemmli (1970) 的方法。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
藥品試劑: |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
由於鑄膠溶液非常重要且多樣,因此下面把所有電泳溶液的配置方法仔細列出,希望能在每一個實驗室成功進行電泳;但使用者一定要明白其配製的原理與各種濃度的算法,而不是只會依配方泡製而已。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
A 液: 丙烯醯胺液 (total 30%, cross-linking 2.6%) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
B 液: 分離膠體緩衝液 (running 或 separation buffer) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C 液: 焦集膠體緩衝液 (stacking buffer) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
D 液: 電泳緩衝液 (chamber buffer),5× 溶液 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
E 液: SDS-PAGE 樣品溶液,2× 溶液 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
F 液: 通用電泳緩衝液,5× 溶液 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SDS 水溶液 (10%) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
APS 溶液 (過硫酸銨, 5%): |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
追蹤染料 (tracking dye): |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
染色液 (CBR 染液): |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
脫色液 (20% 甲醇及 10% 醋酸): |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
標準分子量組合︰ |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
高分子量組: Thyroglobulin (669kD, 330 kD), ferritin (440 kD, 220 kD, 18.5 kD), catalase (232 kD, 36 kD), albumin (67 kD) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
低分子量組: Phosphorylase (94 kD), albumin (67 kD), ovalbumin (43 kD), carbonic anhydrase (30 kD), trypsin inhibitor (20 kD), lactalbumin (14.4 kD) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
另外 Novex 有預先染好藍色的 SeeBlue (LC5625) 標準蛋白質組合,除了一般電泳外,更可用在轉印,檢查轉印是否成功: |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SeeBlue: Myosin (250 kD), albumin (98 kD), glutamic dehydrogenase (64 kD), alcohol dehydrogenase (50 kD), carbonic anhydrase (36 kD), myoglobin (30 kD), lysozyme (16 kD), aprotinin (6 kD), insulin B chain (4 kD) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
請注意: SeeBlue 的分子量標度會隨著膠體濃度的不同而有所變化。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方法步驟: |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SDS 平板膠片鑄造︰ |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1) 整理出兩組玻璃片及白板鑄膠組合,先用酒精拭淨,並選擇合適的間隔條 (0.75 mm) 組合起來。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
u請熟悉鑄膠三明治組合的正確組裝方式,以免灌入的膠液漏出來。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2) 三明治組合後直立站好,準備所要濃度的 SDS 膠體溶液如表 4.2。 兩片 0.75 mm 厚的平板膠片約需 10 mL 分離膠體溶液,以及 5 mL 焦集膠體溶液。APS 液到最後才加入,未加 APS 以前可在真空中抽去溶液中的氧氣。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
表 4.2 配製兩片 0.75 mm 膠片所需膠體 (mL) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
u上表粉紅色部份為使用 40% A 液製備的配方。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3) 以上分離膠體各成份在小燒杯中混合均勻後,可直接沿著玻璃一側倒入鑄膠組合到預定高度 (約八成高),勿陷住氣泡;再輕輕加上一層 isopropanol。 也可使用滴管慢慢加入膠體,同樣勿注入氣泡。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4) 約 30 min 可凝結,以濾紙吸去 isopropanol,同法倒入焦集膠體溶液,要加到滿;儘快 插入樣品槽齒模,注意不可有氣泡陷在膠體中。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
u一般在凝膠完成後,膠體與所加的水層之間,會出現清楚的直線界面,但因為背景為白色,較不易觀察之。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5) 再度凝結後取下齒模即可使用。若不立刻使用,則把整個膠片組合用保鮮膜包好,膠面上方加一水層,勿使乾掉,在 4℃ 約可放 1~2 週。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
電泳方法︰ |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6) 若膠片組合保存於 4℃,則要等待膠片完全回復室溫,才架到電泳槽。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
u膠片一定要完全回溫,否則在進行電泳時,玻璃會因熱脹而破裂。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7) 取 F 液稀釋成一倍溶液,並加 SDS 成為 0.1%;先倒入下方的正極槽,注意不可有氣泡黏在膠體,然後倒入上方的負極槽。用微量針筒或微量吸管一個一個清洗樣本槽,除去殘留在槽內的膠體 (刷牙)。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
u刷牙的動作很重要,而且要徹底,否則注入樣本時,會有大麻煩。又因為白色氧化鋁板乃白色背景,不容易看出樣本槽的位置,可用 Hoefer 所附的透明樣本槽位置模板,作為指引,順便可練習樣本添加的動作。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8) 取蛋白質樣本溶液,加入同體積 E 液,以及適量追蹤染料 bromophenol blue,混勻後在 100℃ 加熱 10 min。放冷短暫離心後即可依次以微量吸管注入樣本槽,樣本體積可自斟酌,但要記好位置及體積;通常都使用 5~15 mL。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
u注入樣本時,儘量把針頭或吸管伸到樣本槽底部,但不要觸到樣本槽底的膠面,則可以使得 樣本所佔的體積最小,分離效果較好。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9) 裝上電源蓋,以 100~150V 進行電泳,最高可加至 200V,視實驗的緊急程度,以及膠片發熱的情形而定。通電後兩極附近會立刻產生無數細微氣泡,是通電的特徵。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10) 追蹤染料很快進入膠體,開始焦集成藍色細線,並向下泳動,大約 1 h 可泳動到底邊,中止電泳,除去電源蓋。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
u有些 分子量較大 的樣本,或使用濃度較高的膠片,可以等到藍色細線泳出膠體才停止。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11) 取出膠片組合,使玻璃板向上,先除去兩側間隔條,再以扁形藥匙輕輕撬起玻璃,膠片則留在白板上。切除焦集膠體,並在分離膠片的右上方截角做記號 (區別膠片的左右)。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12) 取染色盤 (大約比膠片稍大),倒入 CBR 染色液,在染色盤上方把上述白板倒翻過來,挑起膠片一角,利用重力使膠片掉落到染色缸中。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
u若要進行蛋白質轉印,則膠片不能染色,要浸入轉印緩衝液中。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13) 在 CBR 中染色約 30 min,染色盤要加密蓋,置於旋轉平台慢速 50 rpm 搖盪之;要注意膠片是否完全沒入染色液中,否則會造成染色不均勻。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14) 染色後小心把 CBR 染劑倒回原來瓶中,整塊膠片變成藍色,先用自來水洗掉殘餘的染色液,再倒入約 20 mL 脫色液,加密蓋後再放回旋轉平台搖盪。染色脫色過程請戴手套,否則會在膠片上留下指紋。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15) 膠片的藍色背景漸漸脫掉,待脫色液轉成藍色後,可以換新脫色液;如此脫色數次,在一小時內應可看到蛋白質的藍色色帶出現。用過的脫色液,請回收倒在有機溶液的廢液桶中。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16) 待膠片背景完全透明後,染色脫色完成。倒去脫色液,改用 50% 甲醇液洗一兩次,待膠片縮至大約原來的尺寸,則可準備乾燥之。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
膠片乾燥法: |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17) 把玻璃紙 cellophane 先用水浸溼,平鋪在乾燥用的玻璃片上,玻璃紙會比玻璃片大,因此四週有多出來的部份。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18) 把膠片平鋪在玻璃紙中央,膠片與玻璃紙間不要有任何氣泡。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
u除了氣泡之外,若膠片沒有回復原來的大小,或者膠片的四邊有傷痕,都很容易造成膠片乾燥後的龜裂現象。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19) 在膠片上再加一層浸溼的玻璃紙,也不要陷有氣泡在內;把玻璃紙多出來的部份反摺到玻璃背面,用手抹平表面水份,並用紙巾吸乾。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
20) 把此乾片三明治組合放在桌上,次日即可得到已經乾燥好的膠片,用電風扇或冷氣機吹之,可以加快乾片速度。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
u有乾片後用指甲尖輕敲膠片,若還可以看到指甲所留下的痕跡,表示膠片並未完全乾燥,要再等候。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
21) 待膠片完全乾燥後,以美工刀或剪刀去除多餘的玻璃紙,再加以護貝,則可永久保存之。免疫染色的轉印紙,也可以護貝保存。 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
蛋白質轉印法 |
|||||||||||||||||||||||||||
蛋白質經 SDS-PAGE 後,膠片浸入轉印緩衝液,蛋白質可被 轉印 到硝化纖維紙 (nitrocellulose) 上,先經尿素洗去 SDS,並使蛋白質回復原態抗原性,可使用抗體進行 免疫染色 (Towbin et al, 1979)。 |
|||||||||||||||||||||||||||
儀器用具: |
|||||||||||||||||||||||||||
轉印槽 (可容納 4 個轉印三明治) |
|||||||||||||||||||||||||||
轉印三明治 (轉印夾、方形海綿墊 2 片) |
|||||||||||||||||||||||||||
轉印紙:早期使用硝化纖維紙,現在多用尼龍材質者 |
|||||||||||||||||||||||||||
濾紙 (Whatman #1, 3MM) 兩張,裁成比轉印紙稍大者。 |
|||||||||||||||||||||||||||
供電器 (可供 400~500 mA 者) |
|||||||||||||||||||||||||||
方形培養皿 (轉印紙清洗用) |
|||||||||||||||||||||||||||
旋轉搖盪器 (rotary shaker) |
|||||||||||||||||||||||||||
藥品試劑: |
|||||||||||||||||||||||||||
轉印緩衝液 (Blotting buffer): 10×溶液 |
|||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||
甲醇 (用來潤溼尼龍材質的轉印紙) |
|||||||||||||||||||||||||||
PBST 洗液: |
|||||||||||||||||||||||||||
PBST 為 pH 7.0 的 PBS (phosphate buffered saline) 緩衝液,另加有 0.05% Tween-20,用來清洗轉印紙,以去除非專一性的蛋白質吸附。 |
|||||||||||||||||||||||||||
尿素洗液 (6 M Urea-PBST) : |
|||||||||||||||||||||||||||
尿素 180 gm 溶在 300 mL PBST 中,加溫攪拌溶解,再加 PBST 至 500 mL。 |
|||||||||||||||||||||||||||
方法步驟: |
|||||||||||||||||||||||||||
u全程請 戴手套操作,以免污染轉印紙! |
|||||||||||||||||||||||||||
1) 電泳後 SDS-PAGE 膠片浸在轉印緩衝液中,洗 2~3 次,每次 10 min。 |
|||||||||||||||||||||||||||
2) 取出轉印槽,先小心放一攪拌子在底部,再倒一半轉印緩衝液。 |
|||||||||||||||||||||||||||
u攪拌子千萬不能丟到轉印槽內,會打破轉印槽底部的陶瓷散熱片。 |
|||||||||||||||||||||||||||
3) 取轉印紙切成約如膠片大小,先在方形培養皿中以少許甲醇浸溼數秒鐘,再置入轉印槽中的緩衝液 10 min 後使用。 另取兩張濾紙,以及兩片方形海綿墊,都放在轉印槽的緩衝液中備用。 |
|||||||||||||||||||||||||||
4) 取出轉印夾打開平放,先墊一張方形海棉墊,舖上一張溼濾紙,小心疊上已潤溼的轉印紙,其間 勿陷入氣泡;轉印紙再滴上數滴緩衝液後,小心平舖膠片上去,加蓋一層濾紙,及另一張海綿,也都不可陷入氣泡,即可把整個轉印三明治卡夾裝好。 |
|||||||||||||||||||||||||||
u膠片疊到轉印紙時,最好一次成功,不要重作,否則蛋白質色帶可能會印上去,最後產生重疊影像。 |
|||||||||||||||||||||||||||
5) 將轉印三明治置入已經放有一半轉印緩衝液的轉印槽中,注意有 轉印紙的那一面向正極 (紅色),膠片那面向負極 (黑色)。 |
|||||||||||||||||||||||||||
6) 當三明治都放入轉印槽後,以轉印緩衝液蓋滿所有的三明治,小心動一動卡夾,除去附在卡夾內外的氣泡,蓋上蓋子,放到一攪拌器上,打開攪拌器開始攪拌,同時接好電源,裝置完成後放置 10 min。 |
|||||||||||||||||||||||||||
7) 以 400 mA 開始轉印,溫度會漸漸上升,轉印 1.5 h 後中止轉印,取出轉印三明治,打開後依次取出轉印紙及膠片。 |
|||||||||||||||||||||||||||
u上述轉印條件會使溫度上升至 70~90℃,若有冷卻系統,可把溫度控制設在 5℃;轉印槽內應該加以攪拌,以便使整個溫度分佈均勻。 |
|||||||||||||||||||||||||||
8) 轉印後的膠片可以繼續進行 CBR 染色,看有無蛋白質殘留。 若電泳時加有藍色標準蛋白質 marker (SeeBlue),則 可在轉印紙上看到藍色的色帶,確定轉印成功,並可評估轉印效率。 |
|||||||||||||||||||||||||||
9) 轉印紙浸在約 15 mL 尿素洗液中浸洗過夜,期間換三次尿素洗液,並且要溫和搖盪之。 |
|||||||||||||||||||||||||||
10) 若不做免疫染色,則轉印後不用尿素洗液清洗,以清水沖過後改用 amido black (l % 溶於 10% 甲酸) 染色 1 h,再以 10% 甲酸脫色,沖水後晾乾即可,但其 靈敏度較低。 |
|||||||||||||||||||||||||||
註解討論: |
|||||||||||||||||||||||||||
a. 轉印時槽內的水溫並不均勻,液面的溫度比底部要高,電流也就不會均勻,注意轉印效果因此會有差異;最好加以攪拌使水溫均勻。 |
|
||||||||||||||||||||||||||
b. 膠片及轉印紙應切角做記號,以分辨左右或正反面,免得呈色後分不清樣本的次序。 |
|
||||||||||||||||||||||||||
c. 甲醇可提高到 20%,一般 分子量越小,所用甲醇的含量越高;但甲醇含量太高,可能會使分子量太大者不易泳離膠體。 |
|
||||||||||||||||||||||||||
|
免疫染色法 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
轉印到紙上的蛋白質抗原,可與其專一性抗體結合,再以 二次抗體-酵素結合體 (2nd Ab-HRP) 或 Protein A-HRP 呈色;可在一群轉印色帶中,專一性地挑出目標蛋白質,是最有用的檢定工具 (Burnett, 1981)。 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
藥品試劑: |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
抗體溶液: 可用傳統抗血清或單株抗體,其最適使用濃度,隨抗體效價不同而異,以下為一般適用範圍的參考,均以 明膠-NET 稀釋之。 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
a. 傳統抗血清: 1:100 到 1:1,000 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
b. IgG (冷凍乾燥品): 10~50 mg/mL |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
c. 單株抗體 (小白鼠腹水): 1:200 到 1:5,000 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
d. 單株抗體 (細胞培養液): 原液或 1:10 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
明膠-NET: 用來稀釋抗體溶液或酵素連結體 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
酵素連結體: |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
可使用 2nd Ab-HRP 或 Protein A-HRP,使用濃度每家商品不同,約為 1:1,000 到 1:5,000 之間,以 明膠-NET 稀釋之。 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DAB 基質溶液: |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方法步驟: |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1) 尿素洗過夜的轉印紙再以 10 mL PBST 洗三次,每次約 10 min,均在上述方形培養皿中進行。 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2) 轉印紙放在 明膠-NET 溶液中反應,置室溫中反應 1 h。一般使用方形培養皿當容器,但亦可裝入塑膠袋中反應,較節省試劑用量。 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3) 反應後,以 PBST 浸洗二次。 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4) 把轉印紙放在抗體溶液中反應,置室溫反應 1 h。 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5) 反應後以 PBST 洗三次,改用酵素連結體反應,在室溫下反應 1 h。 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6) 以 PBST 洗四至五次,注意 容器也要洗乾淨。 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7) 加入 DAB 基質溶液約 10 mL 呈色,儘量避光,並且不時搖動呈色液。 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8) 數分鐘內可呈色,在背景加深前倒去 DAB,以水沖過數次後晾乾。 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
註解討論: |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
a. 非專一性的呈色經常會造成困擾,此問題可用尿素洗液解決,尿素可洗去 SDS,且使蛋白質或胜汰回復其構形或抗原性。 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
b. DAB 呈色時,應含有一不會呈色之 負對照組 作為比較; 當樣本含有標準分子量的組合時,其蛋白質色帶應不會呈色。 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
||
參考文獻: |
||
Affinity chromatography - Principles and methods, Pharmacia Biotech 操作手冊 |
||
Bradford MM (1976) A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding. Anal Biochem 72: 248-254 |
||
Burnett WN (1981) Anal Biochem 112: 195-203 |
||
Gel filtration - Principles and methods, 6th ed, Pharmacia Biotech 操作手冊 |
||
Ion exchange chromatography - Principles and methods, ed AA, Pharmacia Biotech 操作手冊 |
||
Jefferson RA, Burgess SM, Hirsh D (1986) b-Glucuronidase from Escherichia coli as a gene-fusion marker. Proc Natl Acad Sci USA 83: 8447-8451 |
||
Laemmli UK (1970) Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature 227: 680-685 |
||
Protein Liquid Chromatography (2000) Kastner M ed, J Chromatography Library Vol 61, Elsevier |
||
Scopes RK (1994) Protein purification - Principles and practice, 3rd ed, Springer-Verlag |
||
Towbin H, Staehelin T, Gordon J (1979) Electrophoretic transfer of proteins from polyacrylamide gels to nitrocellulose sheets: Procedure and some applications. Proc Natl Acad Sci USA 76: 4350-4354 |
||
參考網頁: 酵素純化與分析 (140.112.78.220/~juang/ECX/index.htm) |
||
致 謝: |
||
Chap4 |
||
▲ TOP ▲
■ 最近修訂日期︰ 2002/07/28