酵素化學實驗 Z 基本操作 | |||||||
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Z0 基本操作訓練 |
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本實驗課程排有六種最基本的實驗操作 (Z1-Z6),是所有純化與分析方法的基石;因此在正式進行純化流程之前,先在第零週前兩天的講習課程內,完成這些基本操作訓練。其目的是要養成正確的操作習慣,以便在未來的各週實驗中,能夠有效地執行複雜的實驗。基本操作訓練分成六項,每項依序輪流進行,請注意每一操作單元的目標。 |
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基本操作的訓練目標及地點: |
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基 本 操 作 |
目 標 |
地點 |
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正確使用自動吸管 |
實驗桌 |
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自動吸管的校正與維護 |
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對 mL 及 mL 微量體積的感覺 |
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正確使用天平及 pH 計 |
準備室 |
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天平及 pH 計的校正方法 |
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使用天平及 pH 計的習慣及禮儀 |
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正確使用高速離心機 |
離心機 |
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安全問題 (一定要平衡好) |
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使用離心機的習慣及禮儀 |
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正確使用光度計的方法 |
光度計 |
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正確使用 ELISA reader |
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各種光度計的校正方法 |
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透析膜處理法 |
細胞離心機 |
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透析袋使用方法 |
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超微膜離心濃縮法 |
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重要軟體介紹 (MS Word, SigmaPlot) |
電腦室 |
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網路使用 (Reference Manager) |
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電腦使用方法及規則 |
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建議的訓練方式: |
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1. 在第零週的基本訓練中,將上述 Z1-Z6 分成兩天訓練;通常第一天 Z1, Z3, Z5,第二天 Z2, Z4, Z6;Z1 與 Z2 必須安排在不同日,因為兩者都要用到天平。 |
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2. 每天的三項操作訓練設立為三站,由三位助教分別擔任各站主持人;同學分成三組,輪流到每一站聽取講解;每站的講解時間為 20 min,時間一到馬上移動到下站。 |
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3. 如此輪完三站的講解後解散,但同學必須到每一站去接受操作檢定,操作正確無誤者過關,由主持助教簽名,完成當天的三項科目後才能離去。 |
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4. 助教請就各項操作的注意要點監督,若學生操作不夠正確,必須排隊重來一次,並在旁觀看同學操作,一直到完全正確為止。 |
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酵素化學實驗 | |||
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Z1 自動吸管 |
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自動吸管 (autopipet) 是所有實驗最基本的配備,有如步兵的步槍一樣,若一支步槍的射擊校正不夠準確,則是打不到目標的。 請一定要先小心校正你的自動吸管,以免往後整個實驗過程的取量都有問題。 |
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儀器用具: |
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自動吸管 Pipetman P-20, P-200, P-1000, P-5000 各一支 |
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各種容量的吸管頭 (tip): 黃色 (20, 200 mL), 藍色 (1000 mL), 無色 (5 mL) |
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天平 (9.999) 及秤量船 (要多借用幾台天平,以免同學久候) |
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純水及燒杯 |
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操作項目: |
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1. 要試用過每一種大小的自動吸管。 |
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2. 用自動吸管吸取定量的水到天平上秤量,看體積與重量間的關係。 |
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3. 拆開自動吸管,熟悉內部構造;裝回去以後,再次確定取量是否精確。 |
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注意事項: |
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1. 當吸管接上 tip 後,一定要確定有緊密接上,否則取量會不準。 |
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2. 吸取溶液時,一定要小心吸上或放出,速度太快就會吸入空氣。 |
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3. 用 1 mL 以上的自動吸管時,在吸取溶液後 tip 尖端不要馬上離開液面。尤其在吸取密度或黏滯度很高的液體時,要等候更長久的時間 (3-5 秒)。 |
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4. 要自己練習一看到 tip 內液體的高度時,即可猜出有若干體積。 |
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5. 吸有液體的自動吸管,不得放下平躺或倒置,溶液會流入吸管中。 |
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6. 拆開自動吸管後,小心其中各個零件,不要遺失或沾上灰塵;內部不可塗抹凡士林。 |
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7. 若自動吸管本體不小心吸入液體,要馬上拆開清理後擦乾。 |
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8. 千萬不可把自動吸管掉到地上! 自動吸管不可用火烤! |
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問題與檢討: |
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1. 如何發現你的 tip 並沒有裝得很緊密? |
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2. 如何確定你的自動吸管是準確的? |
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3. 儘量節省 tip,當你吸取同一溶液的系列濃度時,需不需要每次都換 tip? |
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4. 某生匆匆取了一支自動吸管,轉到刻度 50 後,急忙吸取 50 mL,可能有何差錯? |
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5. 你如何以自動吸管取用 0.5 mL 50% 甘油? |
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酵素化學實驗 | |||
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Z2 天平及酸鹼度計 |
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天平及酸鹼度計都是實驗室中常用且重要的儀器;像自動吸管一樣,若沒有操作或校正好,所有的實驗將都會有問題。 Tris 可以作為良好的緩衝液分子,Sigma 售有 Tris 的 acid 及 base 兩種形態,以不同的重量比例混合,可配製出不同 pH 的溶液;本操作將指定一個 pH,讓同學查表秤取兩種 Tris,配製出來的溶液,可用酸鹼度計測量其 pH 是否正確。 另外,測量 Tris 的 pH 需使用特定的酸鹼度計,其酸鹼度探針 (probe) 上的透膜可以耐 Tris。 |
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儀器用具: |
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天平 (9.999) 及秤量船 (最好能借到五台天平,以免同學久候) |
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酸鹼度計 及標準酸鹼度溶液 (使用耐 Tris 的探針,兩台即可) |
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Tris HCl 及 Tris base (Sigma 各種 pH 的 Tris 緩衝液配製表) |
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純水及燒杯 |
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攪拌器及攪拌子 |
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操作項目: |
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1. 校正電動天平。 |
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2. 校正酸鹼度計。 |
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3. 配製 100 mL Tris 緩衝液 (50 mM, pH 由助教指定)。 |
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注意事項: |
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1. 使用前先檢查天平的位置是否水平,可能的話還要校正天平。 |
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2. 小心酸鹼度計的探針很容易被打破,也不能長久暴露於空氣中。 |
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3. Tris 緩衝液的 pH 受溫度影響很大,要注意當日的室溫如何。 |
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4. 使用天平及酸鹼度計最容易弄髒實驗桌,使用後桌面一定要清理乾淨。 |
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5. 許多有害的物質,在秤量時要注意勿吸入肺部。也小心處理使用後的秤量紙,要小心輕輕包好後,才置入垃圾桶中;毒劇藥的用紙不能隨便丟到垃圾桶中。 |
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問題與檢討: |
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1. 若你所配製出來 Tris 緩衝液的 pH 不對,可能有哪些地方出了問題? |
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2. 為何校正酸鹼度計要使用兩種標準 pH 液? 而且其中一個必須是 pH 7.0? |
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3. 為什麼有些緩衝液在室溫或空氣中久置後,酸鹼度會改變? |
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4. 如何經由觀察即可得知某一台天平或酸鹼度計準不準確? |
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酵素化學實驗 | |||
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Z3 離心機 |
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離心機是實驗室極常見的分離工具,通常依其使用目的可分成數種:低速離心機、高速冷凍離心機、超高速真空離心機等;低速又有細胞離心機,以及常見的微量離心機等。使用離心機首重安全,因為離心力失控可能造成很大的破壞;因此要注意離心管是否有平衡,離心轉速是否超過極限,離心陀是否有腐蝕或過荷。 |
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儀器用具: |
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離心陀 及離心管 |
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微量離心機 (microfuge) |
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懸臂式粗天平 |
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操作項目: |
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1. 平衡離心管。 |
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2. 離心機操作方法。 |
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3. 離心機及離心陀的保養方法。 |
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注意事項: |
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1. 通常離心機都會有登記表,請在使用前 確實登記 (使用者、轉陀、轉速、時間)。 (下載本實驗室離心機登記表 20, 22) |
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2. 離心管一定要平衡好,放入離心陀時也要注意位置平衡。絕對不要超過離心機或離心陀的最高限轉速。 |
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3. 一定要在達到預設轉速後,才能離開離心機;若有任何異狀,要立刻停機。 |
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4. 通常聽聲音即可得知離心狀況是否正常,也可注意離心機的震動情形。 |
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5. 使用硫酸銨等高鹽溶液樣本後,一定要把離心陀洗乾淨,也要清理離心機轉艙。 |
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6. 超高速離心機則因轉速極高,也更加複雜,需要另外的專門訓練才可使用。 |
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問題與檢討: |
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1. 高速以上的離心機為何要冷凍或者抽真空? |
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2. 你已經很小心地把兩隻樣本離心管平衡好,但開動離心機後,還是發生不平衡狀況,停機後取出再秤一次,發現兩隻離心管還是平衡的;請問為何會發生不平衡? |
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3. 離心陀一般分成懸籃式 (swing bucket) 及角型 (angular) 兩大類,使用上有何差別? |
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4. 一般論文中記載的離心條件,有人記錄轉速 (如 8,000 rpm),有人記錄離心重力 (如 10,000g);二者有何不同? 何者較為適當? |
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以下用 日立 20PR-5 機型為範例,詳細說明離心機的操作步驟。 |
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使用步驟: |
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通常使用離心機前都要登記,請養成登記習慣。 |
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1. 設定使用溫度 (通常為 4℃) 後,先把離心陀放入離心艙中,注意離心陀要卡好軸心;關上艙門,離心艙的溫度開始下降,預冷時間要充足。 |
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2. 把樣本裝入適當的離心管,雙雙用天平平衡重量,蓋上離心管蓋子並旋緊。 |
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◆ 注意離心管只裝七成滿,雖然加有蓋子,但也可能因離心力太強而外洩。 |
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◆ 大部分離心管都附有蓋子,注意離心管的蓋子也要一起平衡。 |
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◆ 離心管通常都會放在碎冰上,注意取出平衡時,要把碎冰的液體擦拭乾淨。 |
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◆ 落單的離心管要用另一隻裝有清水的離心管平衡。 |
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3. 把平衡好的離心管對稱地放入離心陀中,蓋上離心陀的蓋子,注意有無旋緊。 |
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◆ 若離心陀的蓋子沒旋緊,離心時會掉出來,造成很大的傷害! |
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4. 關上離心機艙門,在儀表板上調好所要的轉速與時間 (例如 8,000 rpm, 30 min)。 |
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◆ 注意所用轉速 絕對不能超過離心陀的限定,最高轉速通常寫在離心陀上面,例如 RPR20 的最高轉速為 20,000 rpm,但若離心機太老舊,必須往下調降。 |
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◆ 轉速與時間設定儘量不要太高,例如能使用 7,000 rpm 者就不要用 8,000 rpm。 |
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5. 確定所有步驟無誤後,按 Start 鈕開動,離心機漸漸加速,此時要密切監控。 |
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◆ 有些老式的時間轉鈕,設定 5 min 以下時,要先轉過 10 min 再轉回 5 min。 |
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◆ 按 Start 的按鈕時,按住時間不能太短,請持續按約一秒鐘後才鬆開。 |
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◆ 開始加速的時候最危險,若發現聲音不對,或產生大震動,請立刻按 Stop。 |
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6. 等到離心達到所要的轉速後,確定一切正常才可離去。 |
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7. 完成離心時,要等離心陀完全靜止後,才能打開艙門;請儘快取出離心管,先觀察離心是否完全,以及沈澱的位置,儘速把上清倒出,小心不要把沈澱弄混濁。 |
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◆ 不管所要的是上清或沈澱,請取用乾淨的燒杯收集上清,以免有失誤。 |
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◆ 傾倒上清要很小心,以免把沈澱一起倒出來;若不慎混在一起,就要重來一次。 |
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◆ 若離心管有漏,要找出原因,並且立刻清理離心陀或離心艙。 |
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8. 在兩次離心之間的空檔,不需取出離心陀,但蓋上艙門,勿讓熱空氣流入離心艙。 |
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9. 全部使用完畢後,取出離心陀清理,可以用自來水沖洗,並且倒放晾乾之。離心艙門要打開,等結冰融化後,再稍加擦拭及清理,若有液體漏出,要用清水洗之。也要回頭檢查平衡離心管的天平以及桌面,很容易弄髒,要仔細清理乾淨才離開。 |
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酵素化學實驗 | |||
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Z4 光度計及 ELISA 計 |
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光度計是實驗室最基本的測量儀器,通常以光源區分為可視光及紫外線兩種,機型有簡單的,也有很複雜的形式;另可分為使用測光管的傳統機型,以及近年來流行使用微量滴定盤的 ELISA 光度計,後者一般只能讀可視光,只有少數貴重機型可以讀紫外光。 |
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儀器用具: |
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普通光度計 及測光管 (cuvette) |
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ELISA 光度計 (Dynatech 或其他廠牌) |
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微量滴定盤 (microtiter plate) |
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操作項目: |
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1. 普通光度計的使用及校正方法。 |
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2. 測光管的維護及保養。 |
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3. 微量滴定盤的使用。 |
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4. ELISA 光度計的使用方法。 |
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注意事項: |
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1. 通常光度計都有登記表,請在使用前 確實登記 (使用者、波長、樣本、時間)。 |
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2. 光度計最忌忽開忽關,供應電源不穩,或者不使用而長時間開著燈泡;回家前應當檢查光度計是否已經關掉,並且把光度計清潔乾淨。 |
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3. 使用紫外光時,測光管一定要用石英材質者,其他材質者無法透光;同時,測有色物質的溶液時,要避免使用石英測光管。 |
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4. 新型光度計都有複雜的電腦系統,不會使用者經常會搞得當機,請先請問他人。 |
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5. 微量滴定盤的底部請保持乾淨,且滴定槽內不能有氣泡,以免干擾測光。 |
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6. 每次測吸光前,要注意使用的波長對不對,空白組是否有做好。 |
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問題與檢討: |
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1. 請描述光度計的測光原理,樣本的吸光度大小與樣本的哪些性質有關? |
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2. 蛋白質、核酸在多少波長會有吸光? 為何它們會吸光? |
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3. 有些反應的生成物會有顏色,就可以利用微量滴定盤進行測定;但若此反應過程要加熱,而微量滴定盤無法耐熱,則如何使用 ELISA 光度計來測光? |
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4. 光度計可靠的吸光值範圍多少? 若超過最高可靠值,應當如何處理? |
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酵素化學實驗 | |||
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Z5 透析及濃縮 |
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透析與濃縮也是極為基本而且重要的實驗步驟。兩者都是利用薄膜的通透性,來區別分子大小,而達到透析或濃縮的目的。本實驗課程則使用最傳統的透析袋進行透析,另以離心式的薄膜濃縮器進行濃縮,主要是因為其方便性,且可供多數樣本同時進行。 |
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儀器用具: |
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透析膜 (前處理方法如下): |
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1. 戴手套把透析膜剪成適當長度,浸在蒸餾水中 15 min 泡軟。 |
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2. 浸入 10 mM sodium bicarbonate 中,並加熱至 80℃,一邊攪拌至少 30 min。 |
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3. 換到 10 mM Na2·EDTA 中浸泡 30 min,以新鮮的 EDTA 同樣方法處理三次。 |
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4. 再用 80℃ 蒸餾水洗 30 min,然後換到 20% 酒精中,放在 4℃ 冰箱中保存。 |
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透析夾、攪拌子、攪拌器及 5 L 塑膠燒杯 (裝蒸餾水 4 L) |
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細胞離心機 (懸藍式 3,000 rpm) |
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離心濃縮管 (Centriprep, Amicon; User Guide) |
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樣本:Blue Dextran + FMN (濃度不拘,看得到顏色即可,每人約 10 mL) |
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操作項目: |
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1. 綁一個透析袋,裝約 5 mL 樣本,使其浮於大燒杯內的水面上,透析過夜。 |
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2. 觀察 Centriprep 的構造與其濃縮的原理,注意所要收集的部位為何。 |
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3. 試以離心濃縮管處理 5 mL 樣本;注意控制好離心速度,一般離心機都不超過 3,000 rpm,而離心時間不用太久,看到顏色變化即可。 |
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注意事項: |
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1. 取出透析袋要先用蒸餾水清洗乾淨,綁透析袋前要先試裝蒸餾水,看透析袋有沒有蛀孔,會不會有水噴出。 綁透析袋不要太用力拉扯,否則透析袋可能會裂開。 |
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2. 一般透析至少要 3 h,至少要換兩次透析液 (100 至 1000 倍樣本體積) 才能完全。 |
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3. 注意離心濃縮管的離心轉速不能太快,否則薄膜很容易破裂。 |
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4. 每次離心濃縮後,暫時不要丟掉外濾液 (filtrate),收集起來以防薄膜破裂流失。 |
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問題與檢討: |
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1. 記下透析與薄膜濃縮的結果比較,樣本的顏色有無變化? |
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2. 透析後常常發現透析袋內產生大量沈澱,是何原因? |
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3. 如何察覺或檢定你的離心濃縮管有無破裂? |
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酵素化學實驗 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Z6 電腦及軟體 |
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電腦是極為強大的工具,如運用得當,可使你的研究或做事能力倍增;下面列出一些常用的軟體,及其使用時機,請自行學習使用。 資訊網路則是另一個世界,在資訊的獲取上非常重要,千萬不可忽視。 |
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儀器用具: |
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個人電腦及印表機 |
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網路連線 |
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電腦套裝軟體 (如下表) |
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★, 一定要純熟使用 ☆, 建議學習使用 ●, 推薦使用 ○, 推薦學習 |
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* 在網路上多使用 GCG (Genetics Computer Group) 巨分子序列分析,可由國家衛生研究院的網站 (http://gcg.nhri.org.tw) 進入,但正式使用 GCG 需申請使用者密碼。 |
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操作項目: |
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1. 啟動個人電腦,試進入以上各套裝軟體,並進行簡單操作使用。 |
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2. 進入本校計算機中心網路及圖書館資料庫,試著找尋一些資料庫 (如 Medline)。 |
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3. 先練習好基本操作,然後在上課期間自行學習使用各種軟體。 |
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注意事項: |
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1. 若使用的電腦設有登記表,請在使用前確實登記 (使用者、使用時間)。 |
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2. 請勿在公共電腦灌入任何軟體,也不要更動電腦上的任何設定,請確實遵守。 |
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3. 儘量不要使用外界磁片,以防中毒;若發現有中毒現象,請立即通知教師。 |
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4. 使用頻率高的軟體,各實驗室應當採購原版軟體;大部分軟體都發行有教育版。 |
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建立日期:2001/4/17 更新日期:2003/01/06 © 版權所有