Z0

     

  酵素化學實驗   Z 基本操作  

到目錄

 

Z0  基本操作訓練

 

  

        

本實驗課程排有六種最基本的實驗操作 (Z1-Z6),是所有純化與分析方法的基石;因此在正式進行純化流程之前,先在第零週前兩天的講習課程內,完成這些基本操作訓練。其目的是要養成正確的操作習慣,以便在未來的各週實驗中,能夠有效地執行複雜的實驗。基本操作訓練分成六項,每項依序輪流進行,請注意每一操作單元的目標。

 

流程圖

 

基本操作的訓練目標及地點:

  基 本 操 作

目  標

地點

 
 

Z1

自動吸管

正確使用自動吸管

實驗桌

自動吸管的校正與維護

對 mL 及 mL 微量體積的感覺

 

Z2

天平及酸鹼度計

正確使用天平及 pH 計

準備室

 

天平及 pH 計的校正方法

使用天平及 pH 計的習慣及禮儀

 

Z3

離心機

正確使用高速離心機   

離心機

安全問題 (一定要平衡好) 

使用離心機的習慣及禮儀

 

Z4

光度計及 ELISA 計

正確使用光度計的方法  

光度計

 

正確使用 ELISA reader  

各種光度計的校正方法

 

Z5

透析及濃縮

透析膜處理法    

細胞離心機

透析袋使用方法

超微膜離心濃縮法

 

Z6

電腦及軟體

重要軟體介紹 (MS Word, SigmaPlot)  

電腦室

 

網路使用 (Reference Manager)  

電腦使用方法及規則

 

   

建議的訓練方式:

 
 

1. 在第零週的基本訓練中,將上述 Z1-Z6 分成兩天訓練;通常第一天 Z1, Z3, Z5,第二天 Z2, Z4, Z6;Z1 與 Z2 必須安排在不同日,因為兩者都要用到天平。

 

2. 每天的三項操作訓練設立為三站,由三位助教分別擔任各站主持人;同學分成三組,輪流到每一站聽取講解;每站的講解時間為 20 min,時間一到馬上移動到下站。

 

3. 如此輪完三站的講解後解散,但同學必須到每一站去接受操作檢定,操作正確無誤者過關,由主持助教簽名,完成當天的三項科目後才能離去。

 

4. 助教請就各項操作的注意要點監督,若學生操作不夠正確,必須排隊重來一次,並在旁觀看同學操作,一直到完全正確為止。

 
       

Z1

     

  酵素化學實驗    

到目錄

 

Z1  自動吸管

 

 

        

自動吸管 (autopipet) 是所有實驗最基本的配備,有如步兵的步槍一樣,若一支步槍的射擊校正不夠準確,則是打不到目標的。 請一定要先小心校正你的自動吸管,以免往後整個實驗過程的取量都有問題。

 

 

 

 儀器用具:

 
 

自動吸管 Pipetman P-20, P-200, P-1000, P-5000 各一支

 

各種容量的吸管頭 (tip): 黃色 (20, 200 mL), 藍色 (1000 mL), 無色 (5 mL)

 

天平 (9.999) 及秤量船 (要多借用幾台天平,以免同學久候)

 

純水及燒杯

 

 

 

 操作項目:

 
 

1. 要試用過每一種大小的自動吸管。

 

2. 用自動吸管吸取定量的水到天平上秤量,看體積與重量間的關係。

 

3. 拆開自動吸管,熟悉內部構造;裝回去以後,再次確定取量是否精確。

 
   

 注意事項:

 
 

1. 當吸管接上 tip 後,一定要確定有緊密接上,否則取量會不準。

 

2. 吸取溶液時,一定要小心吸上或放出,速度太快就會吸入空氣。

 

3. 用 1 mL 以上的自動吸管時,在吸取溶液後 tip 尖端不要馬上離開液面。尤其在吸取密度或黏滯度很高的液體時,要等候更長久的時間 (3-5 秒)。

 

4. 要自己練習一看到 tip 內液體的高度時,即可猜出有若干體積。

 

5. 吸有液體的自動吸管,不得放下平躺或倒置,溶液會流入吸管中。

 

6. 拆開自動吸管後,小心其中各個零件,不要遺失或沾上灰塵;內部不可塗抹凡士林。

 

7. 若自動吸管本體不小心吸入液體,要馬上拆開清理後擦乾。

 

8. 千萬不可把自動吸管掉到地上! 自動吸管不可用火烤!

 
   

問題與檢討:

 
 

1. 如何發現你的 tip 並沒有裝得很緊密?

 

2. 如何確定你的自動吸管是準確的?

 

3. 儘量節省 tip,當你吸取同一溶液的系列濃度時,需不需要每次都換 tip?

 

4. 某生匆匆取了一支自動吸管,轉到刻度 50 後,急忙吸取 50 mL,可能有何差錯?

 

5. 你如何以自動吸管取用 0.5 mL 50% 甘油?

 
       

Z2

     

  酵素化學實驗    

到目錄

 

Z2  天平及酸鹼度計

 

 

        

天平及酸鹼度計都是實驗室中常用且重要的儀器;像自動吸管一樣,若沒有操作或校正好,所有的實驗將都會有問題。 Tris 可以作為良好的緩衝液分子,Sigma 售有 Tris 的 acid 及 base 兩種形態,以不同的重量比例混合,可配製出不同 pH 的溶液;本操作將指定一個 pH,讓同學查表秤取兩種 Tris,配製出來的溶液,可用酸鹼度計測量其 pH 是否正確。 另外,測量 Tris 的 pH 需使用特定的酸鹼度計,其酸鹼度探針 (probe) 上的透膜可以耐 Tris。

 

 

 

 儀器用具:

 
 

天平 (9.999) 及秤量船 (最好能借到五台天平,以免同學久候)

 

酸鹼度計 及標準酸鹼度溶液 (使用耐 Tris 的探針,兩台即可)

 

Tris HCl 及 Tris base (Sigma 各種 pH 的 Tris 緩衝液配製表)

 

純水及燒杯

 

攪拌器及攪拌子

 

 

 

 操作項目:

 
 

1. 校正電動天平。

 

2. 校正酸鹼度計。

 

3. 配製 100 mL Tris 緩衝液 (50 mM, pH 由助教指定)。

 
   

 注意事項:

 
 

1. 使用前先檢查天平的位置是否水平,可能的話還要校正天平。

 

2. 小心酸鹼度計的探針很容易被打破,也不能長久暴露於空氣中。

 

3. Tris 緩衝液的 pH 受溫度影響很大,要注意當日的室溫如何。

 

4. 使用天平及酸鹼度計最容易弄髒實驗桌,使用後桌面一定要清理乾淨。

 

5. 許多有害的物質,在秤量時要注意勿吸入肺部。也小心處理使用後的秤量紙,要小心輕輕包好後,才置入垃圾桶中;毒劇藥的用紙不能隨便丟到垃圾桶中。

 
   

問題與檢討:

 
 

1. 若你所配製出來 Tris 緩衝液的 pH 不對,可能有哪些地方出了問題?

 

2. 為何校正酸鹼度計要使用兩種標準 pH 液? 而且其中一個必須是 pH 7.0?

 

3. 為什麼有些緩衝液在室溫或空氣中久置後,酸鹼度會改變?

 

4. 如何經由觀察即可得知某一台天平或酸鹼度計準不準確?

 
       

Z3

     

  酵素化學實驗    

到目錄

 

Z3  離心機

 

 

        

離心機是實驗室極常見的分離工具,通常依其使用目的可分成數種:低速離心機、高速冷凍離心機、超高速真空離心機等;低速又有細胞離心機,以及常見的微量離心機等。使用離心機首重安全,因為離心力失控可能造成很大的破壞;因此要注意離心管是否有平衡,離心轉速是否超過極限,離心陀是否有腐蝕或過荷。

 

 

 

 儀器用具:

 
 

高速冷凍離心機

 

離心陀 及離心管

 

微量離心機 (microfuge)

 

懸臂式粗天平

 

 

 

 操作項目:

 
 

1. 平衡離心管。

 

2. 離心機操作方法。

 

3. 離心機及離心陀的保養方法。

 
   

 注意事項:

 
 

1. 通常離心機都會有登記表,請在使用前 確實登記 (使用者、轉陀、轉速、時間)。 (下載本實驗室離心機登記表 20, 22)

 

2. 離心管一定要平衡好,放入離心陀時也要注意位置平衡。絕對不要超過離心機或離心陀的最高限轉速。

 

3. 一定要在達到預設轉速後,才能離開離心機;若有任何異狀,要立刻停機。

 

4. 通常聽聲音即可得知離心狀況是否正常,也可注意離心機的震動情形。

 

5. 使用硫酸銨等高鹽溶液樣本後,一定要把離心陀洗乾淨,也要清理離心機轉艙。

 

6. 超高速離心機則因轉速極高,也更加複雜,需要另外的專門訓練才可使用。

 
   

問題與檢討:

 
 

1. 高速以上的離心機為何要冷凍或者抽真空?

 

2. 你已經很小心地把兩隻樣本離心管平衡好,但開動離心機後,還是發生不平衡狀況,停機後取出再秤一次,發現兩隻離心管還是平衡的;請問為何會發生不平衡?

 

3. 離心陀一般分成懸籃式 (swing bucket) 及角型 (angular) 兩大類,使用上有何差別?

 

4. 一般論文中記載的離心條件,有人記錄轉速 (如 8,000 rpm),有人記錄離心重力 (如 10,000g);二者有何不同? 何者較為適當?

 
 

以下用 日立 20PR-5 機型為範例,詳細說明離心機的操作步驟。

   

使用步驟:

   
 

通常使用離心機前都要登記,請養成登記習慣

 

1. 設定使用溫度 (通常為 4℃) 後,先把離心陀放入離心艙中,注意離心陀要卡好軸心;關上艙門,離心艙的溫度開始下降,預冷時間要充足。

 

2. 把樣本裝入適當的離心管,雙雙用天平平衡重量,蓋上離心管蓋子並旋緊。

 

注意離心管只裝七成滿,雖然加有蓋子,但也可能因離心力太強而外洩。

 

◆ 大部分離心管都附有蓋子,注意離心管的蓋子也要一起平衡。

 

◆ 離心管通常都會放在碎冰上,注意取出平衡時,要把碎冰的液體擦拭乾淨。

 

◆ 落單的離心管要用另一隻裝有清水的離心管平衡。

 

3. 把平衡好的離心管對稱地放入離心陀中,蓋上離心陀的蓋子,注意有無旋緊。

 

若離心陀的蓋子沒旋緊,離心時會掉出來,造成很大的傷害!

 

4. 關上離心機艙門,在儀表板上調好所要的轉速與時間 (例如 8,000 rpm, 30 min)。

 

注意所用轉速 絕對不能超過離心陀的限定,最高轉速通常寫在離心陀上面,例如 RPR20 的最高轉速為 20,000 rpm,但若離心機太老舊,必須往下調降。

 

◆ 轉速與時間設定儘量不要太高,例如能使用 7,000 rpm 者就不要用 8,000 rpm。

 

5. 確定所有步驟無誤後,按 Start 鈕開動,離心機漸漸加速,此時要密切監控。

 

◆ 有些老式的時間轉鈕,設定 5 min 以下時,要先轉過 10 min 再轉回 5 min。

 

◆ 按 Start 的按鈕時,按住時間不能太短,請持續按約一秒鐘後才鬆開。

 

開始加速的時候最危險,若發現聲音不對,或產生大震動,請立刻按 Stop。

 

6. 等到離心達到所要的轉速後,確定一切正常才可離去。

 

7. 完成離心時,要等離心陀完全靜止後,才能打開艙門;請儘快取出離心管,先觀察離心是否完全,以及沈澱的位置,儘速把上清倒出,小心不要把沈澱弄混濁。

 

◆ 不管所要的是上清或沈澱,請取用乾淨的燒杯收集上清,以免有失誤。

 

◆ 傾倒上清要很小心,以免把沈澱一起倒出來;若不慎混在一起,就要重來一次。

 

◆ 若離心管有漏,要找出原因,並且立刻清理離心陀或離心艙。

 

8. 在兩次離心之間的空檔,不需取出離心陀,但蓋上艙門,勿讓熱空氣流入離心艙。

 

9. 全部使用完畢後,取出離心陀清理,可以用自來水沖洗,並且倒放晾乾之。離心艙門要打開,等結冰融化後,再稍加擦拭及清理,若有液體漏出,要用清水洗之。也要回頭檢查平衡離心管的天平以及桌面,很容易弄髒,要仔細清理乾淨才離開。

 
       

Z4

     

  酵素化學實驗    

到目錄

 

Z4  光度計及 ELISA

 

 

        

光度計是實驗室最基本的測量儀器,通常以光源區分為可視光及紫外線兩種,機型有簡單的,也有很複雜的形式;另可分為使用測光管的傳統機型,以及近年來流行使用微量滴定盤的 ELISA 光度計,後者一般只能讀可視光,只有少數貴重機型可以讀紫外光。

 

 

 

 儀器用具:

 
 

普通光度計 及測光管 (cuvette)

 

ELISA 光度計 (Dynatech 或其他廠牌)

 

微量滴定盤 (microtiter plate)

 

 

 

 操作項目:

 
 

1. 普通光度計的使用及校正方法。

 

2. 測光管的維護及保養。

 

3. 微量滴定盤的使用。

 

4. ELISA 光度計的使用方法。

 
   

 注意事項:

 
 

1. 通常光度計都有登記表,請在使用前 確實登記 (使用者、波長、樣本、時間)。

 

2. 光度計最忌忽開忽關,供應電源不穩,或者不使用而長時間開著燈泡;回家前應當檢查光度計是否已經關掉,並且把光度計清潔乾淨。

 

3. 使用紫外光時,測光管一定要用石英材質者,其他材質者無法透光;同時,測有色物質的溶液時,要避免使用石英測光管。

 

4. 新型光度計都有複雜的電腦系統,不會使用者經常會搞得當機,請先請問他人。

 

5. 微量滴定盤的底部請保持乾淨,且滴定槽內不能有氣泡,以免干擾測光。

 

6. 每次測吸光前,要注意使用的波長對不對,空白組是否有做好。

 
   

問題與檢討:

 
 

1. 請描述光度計的測光原理,樣本的吸光度大小與樣本的哪些性質有關?

 

2. 蛋白質、核酸在多少波長會有吸光? 為何它們會吸光?

 

3. 有些反應的生成物會有顏色,就可以利用微量滴定盤進行測定;但若此反應過程要加熱,而微量滴定盤無法耐熱,則如何使用 ELISA 光度計來測光?

 

4. 光度計可靠的吸光值範圍多少? 若超過最高可靠值,應當如何處理?

 
       

Z5

     

  酵素化學實驗    

到目錄

 

Z5  透析及濃縮

 

 

        

透析與濃縮也是極為基本而且重要的實驗步驟。兩者都是利用薄膜的通透性,來區別分子大小,而達到透析或濃縮的目的。本實驗課程則使用最傳統的透析袋進行透析,另以離心式的薄膜濃縮器進行濃縮,主要是因為其方便性,且可供多數樣本同時進行。

 

 

 

 儀器用具:

 
 

透析膜 (前處理方法如下):

 

1. 戴手套把透析膜剪成適當長度,浸在蒸餾水中 15 min 泡軟。

 

2. 浸入 10 mM sodium bicarbonate 中,並加熱至 80℃,一邊攪拌至少 30 min。

 

3. 換到 10 mM Na2·EDTA 中浸泡 30 min,以新鮮的 EDTA 同樣方法處理三次。

 

4. 再用 80℃ 蒸餾水洗 30 min,然後換到 20% 酒精中,放在 4℃ 冰箱中保存。

 

透析夾、攪拌子、攪拌器及 5 L 塑膠燒杯 (裝蒸餾水 4 L)

 

細胞離心機 (懸藍式 3,000 rpm)

 

離心濃縮管 (Centriprep, Amicon; User Guide)

 

樣本:Blue Dextran + FMN (濃度不拘,看得到顏色即可,每人約 10 mL)

 

 

 

 操作項目:

 
 

1. 綁一個透析袋,裝約 5 mL 樣本,使其浮於大燒杯內的水面上,透析過夜。

 

2. 觀察 Centriprep 的構造與其濃縮的原理,注意所要收集的部位為何。

 

3. 試以離心濃縮管處理 5 mL 樣本;注意控制好離心速度,一般離心機都不超過 3,000 rpm,而離心時間不用太久,看到顏色變化即可。

 
   

 注意事項:

 
 

1. 取出透析袋要先用蒸餾水清洗乾淨,綁透析袋前要先試裝蒸餾水,看透析袋有沒有蛀孔,會不會有水噴出。 綁透析袋不要太用力拉扯,否則透析袋可能會裂開。

 

2. 一般透析至少要 3 h,至少要換兩次透析液 (100 至 1000 倍樣本體積) 才能完全。

 

3. 注意離心濃縮管的離心轉速不能太快,否則薄膜很容易破裂。

 

4. 每次離心濃縮後,暫時不要丟掉外濾液 (filtrate),收集起來以防薄膜破裂流失。

 
   

問題與檢討:

 
 

1. 記下透析與薄膜濃縮的結果比較,樣本的顏色有無變化?

 

2. 透析後常常發現透析袋內產生大量沈澱,是何原因?

 

3. 如何察覺或檢定你的離心濃縮管有無破裂?

 
       

Z6

     

  酵素化學實驗    

到目錄

  

Z6  電腦及軟體

 

 

        

電腦是極為強大的工具,如運用得當,可使你的研究或做事能力倍增;下面列出一些常用的軟體,及其使用時機,請自行學習使用。 資訊網路則是另一個世界,在資訊的獲取上非常重要,千萬不可忽視。

 

 

 

 儀器用具:

 
 

個人電腦及印表機

 

網路連線

 

電腦套裝軟體 (如下表)

 

 

Package

ver.

Company

實驗上的可能用途

將來用途

Word

2000

Microsoft

撰寫實驗報告

撰寫論文主體

SigmaPlot

4.01

SPSS

製作結果圖表

撰寫論文: 製作圖表

CorelDRAW

9

Corel

製作流程圖及繪圖

撰寫論文: 製作流程圖

PC/GENE*

6.85

IntelliGenetics

蛋白質序列分析

巨分子序列分析

PowerPoint

2000

Microsoft

實驗成果報告

報告論文製作幻燈片

Reference Manager

9.5

ISI

整理資料庫

撰寫論文: 參考文獻

Visio

2000

Microsoft

製作實驗流程圖

撰寫論文: 製作流程圖

Access

2000

Microsoft

整理所有實驗用具

個人資料庫建立

Project

98

Microsoft

規劃實驗課程進度

專案管理

Organizer

97

Lotus

排定每日實驗進度

個人日常生活行程管理

 

★, 一定要純熟使用  ☆, 建議學習使用  ●, 推薦使用  ○, 推薦學習

 

* 在網路上多使用 GCG (Genetics Computer Group) 巨分子序列分析,可由國家衛生研究院的網站 (http://gcg.nhri.org.tw) 進入,但正式使用 GCG 需申請使用者密碼。

 

 

 

 操作項目:

 
 

1. 啟動個人電腦,試進入以上各套裝軟體,並進行簡單操作使用。

 

2. 進入本校計算機中心網路及圖書館資料庫,試著找尋一些資料庫 (如 Medline)。

 

3. 先練習好基本操作,然後在上課期間自行學習使用各種軟體。

 
   

 注意事項:

 
 

1. 若使用的電腦設有登記表,請在使用前確實登記 (使用者、使用時間)。

 

2. 請勿在公共電腦灌入任何軟體,也不要更動電腦上的任何設定,請確實遵守。

 

3. 儘量不要使用外界磁片,以防中毒;若發現有中毒現象,請立即通知教師。

 

4. 使用頻率高的軟體,各實驗室應當採購原版軟體;大部分軟體都發行有教育版。

 
       

 

建立日期:2001/4/17   更新日期:2003/01/06  © 版權所有